RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496927.5

USP20-209, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 5

Gene USP20, Length 646 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-209ENST00000496927 HOXC5Q00444 222 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 HSF1Q00613 529 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 PLAURQ03405 335 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 SLC10A1Q14973 349 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 CYBRD1Q53TN4 286 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 CMPK2Q5EBM0 449 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 GLYATQ6IB77 296 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 SPPL2CQ8IUH8 684 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 ARHGAP24Q8N264 748 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 ZNF843Q8N446 348 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 OR5M1Q8NGP8 315 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 OR5W2Q8NH69 310 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 ZNF563Q8TA94 476 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 VANGL1Q8TAA9 524 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 FAR1Q8WVX9 515 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 PROX1Q92786 737 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 MED17Q9NVC6 651 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 KLHL28Q9NXS3 571 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 SNX13Q9Y5W8 968 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 V9GYQ6 96 aa11.65□□□□□ -0.54
USP20-209ENST00000496927 NBEAQ8NFP9 2946 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 CFAP73A6NFT4 308 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 AP3D1O14617 1153 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 SUV39H1O43463 412 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 C1QL1O75973 258 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 WISP2O76076 250 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 STAMBPO95630 424 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 LINGO3P0C6S8 592 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 UQCRBP14927 111 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 PGCP20142 388 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 TNFRSF1BP20333 461 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 CD247P20963 164 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 SLC6A8P48029 635 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 CRYBA2P53672 197 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 BNIP2Q12982 314 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 GANABQ14697 944 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 QPRTQ15274 297 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 TOMM34Q15785 309 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 DUSP7Q16829 419 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 ZSWIM7Q19AV6 140 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 HYAL4Q2M3T9 481 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 SPATS1Q496A3 300 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 AP1ARQ63HQ0 302 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 POMZP3Q6PJE2 187 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 CYP2R1Q6VVX0 501 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 ZNF550Q7Z398 422 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 COMTD1Q86VU5 262 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 SIAH3Q8IW03 269 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 ZNF440Q8IYI8 595 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 CADM2Q8N3J6 435 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 FAM71CQ8NEG0 241 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 GPR32P1Q8NGA4 272 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 RASSF5Q8WWW0 418 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 NSMCE2Q96MF7 247 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 GPR137Q96N19 417 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 SFXN2Q96NB2 322 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 LRMDAQ9H2I8 198 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 UBQLN3Q9H347 655 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 ADPRHL2Q9NX46 363 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 ICAM5Q9UMF0 924 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 SLC6A5Q9Y345 797 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 CHST2Q9Y4C5 530 aa11.64□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 ATRXP46100 2492 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 NINQ8N4C6 2090 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 B8ZZF3 427 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 GSC2O15499 205 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 ZNHIT1O43257 154 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 EPPINO95925 133 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 HPNP05981 417 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 FESP07332 822 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 PRG2P13727 222 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 GCKP35557 465 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 KCNJ5P48544 419 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 IDH2P48735 452 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 FOXK1P85037 733 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 EPS8Q12929 822 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 FOXF1Q12946 379 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 PLPPR5Q32ZL2 321 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 GFRALQ6UXV0 394 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 ULK2Q8IYT8 1036 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 GPR119Q8TDV5 335 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 LZICQ8WZA0 190 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 SMPDL3BQ92485 455 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 RELTQ969Z4 430 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 HSH2DQ96JZ2 352 aa11.63□□□□□ -0.55
USP20-209ENST00000496927 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms