RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492403.1

EPHB4-208, Transcript of EPH receptor B4, humanhuman

TSL 2

Gene EPHB4, Length 812 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4-208ENST00000492403 FRKP42685 505 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 HLCSP50747 726 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 PLA2G16P53816 162 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 CTXN1P60606 82 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 CXCR4P61073 352 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 YBX1P67809 324 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 DCDP81605 110 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 PPP2R2BQ00005 443 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 RAB32Q13637 225 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 TUBA3CQ13748 450 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 SLC5A12Q1EHB4 618 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 ZBED5Q49AG3 693 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 SAXO2Q658L1 398 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 ZNF425Q6IV72 752 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 LIN54Q6MZP7 749 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 CD300LDQ6UXZ3 194 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 C6orf120Q7Z4R8 191 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 TAGAPQ8N103 731 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 SIMC1Q8NDZ2 872 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 OR1L3Q8NH93 324 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 GIPC3Q8TF64 312 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 SERINC2Q96SA4 455 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 TOR3AQ9H497 397 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 NECTIN3Q9NQS3 549 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 KRT84Q9NSB2 600 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 UTS2RQ9UKP6 389 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 KLK4Q9Y5K2 254 aa9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 A0A0J9YY10 115 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 ARRDC5A6NEK1 342 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 M0QX08 132 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 BTN3A3O00478 584 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 BCKDKO14874 412 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 MPZL2O60487 215 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 PGM3O95394 542 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 ABHD16AO95870 558 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 IL18BPO95998 194 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 TFAP2AP05549 437 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 FESP07332 822 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 FHP07954 510 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 ITGA5P08648 1049 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 CCDC159P0C7I6 412 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 SMIM18P0DKX4 95 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 ETFAP13804 333 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 PVRP15151 417 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 UGT2B7P16662 529 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 CRISP3P54108 245 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 NUP107P57740 925 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 ERVFRD-1P60508 538 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 SSPNQ14714 243 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 NCF4Q15080 339 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 C1orf189Q5VU69 101 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 ADNP2Q6IQ32 1131 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 ZNF773Q6PK81 442 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 RPTNQ6XPR3 784 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 ACOT4Q8N9L9 421 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 NFKBIDQ8NI38 313 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 BBS10Q8TAM1 723 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 MS4A6EQ96DS6 147 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 SLC35G5Q96KT7 338 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 PIP5K1AQ99755 562 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 PRDM7Q9NQW5 492 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 PTTG2Q9NZH5 202 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 PLCL2Q9UPR0 1127 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 POFUT2Q9Y2G5 429 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa9.49□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa9.48□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 A0A0G2JPF8 293 aa9.48□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 TRIM64CA6NLI5 447 aa9.48□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 HNRNPCL2B2RXH8 293 aa9.48□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 HNRNPCL3B7ZW38 293 aa9.48□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 DLGAP1O14490 977 aa9.48□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 EMC8O43402 210 aa9.48□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 ASNA1O43681 348 aa9.48□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 SEMG1P04279 462 aa9.48□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 IFI6P09912 130 aa9.48□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa9.48□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 NR2F6P10588 404 aa9.48□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 NR2F1P10589 423 aa9.48□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 GP1BBP13224 206 aa9.48□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 ETS2P15036 469 aa9.48□□□□□ -0.89
EPHB4-208ENST00000492403 PSMB5P28074 263 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.1 ms