RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491954.5

CIZ1-223, Transcript of CDKN1A interacting zinc finger protein 1, human

TSL 3

Gene CIZ1, Length 955 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CIZ1-223	ENST00000491954	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	UBQLN4	Q9NRR5	601 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	VNN3	Q9NY84	501 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	CHST2	Q9Y4C5	530 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	MAGED1	Q9Y5V3	778 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	CDHR4	A6H8M9	788 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	NPIPB9	F8W1W9	429 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	FAAH	O00519	579 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	PEX12	O00623	359 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	REM1	O75628	298 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ZFAND5	O76080	213 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	CCNB2	O95067	398 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	EPPIN	O95925	133 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	IGKV1D-16	P01601	117 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	IL12B	P29460	328 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ADH7	P40394	386 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	PNLIPRP2	P54317	469 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC26A5	P58743	744 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	NNAT	Q16517	81 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	EXOC3L2	Q2M3D2	409 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF550	Q7Z398	422 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	LACC1	Q8IV20	430 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	C9orf40	Q8IXQ3	194 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	HS3ST5	Q8IZT8	346 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC34A3	Q8N130	599 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF555	Q8NEP9	628 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	TOR1AIP2	Q8NFQ8	470 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	DIO2	Q92813	273 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	NACC2	Q96BF6	587 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ADI1	Q9BV57	179 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	GPR87	Q9BY21	358 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	KIF17	Q9P2E2	1029 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	RHCG	Q9UBD6	479 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	FARSA	Q9Y285	508 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		11.31	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	NPIPA5	A0A0B4J1W7	369 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954		A0A1W2PRQ8	180 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ARRDC5	A6NEK1	342 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ARGFX	A6NJG6	315 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	NPIPA7	E9PJI5	369 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954		H3BNH8	94 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	SCD	O00767	359 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	FFAR1	O14842	300 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	FMO6P	O60774	539 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	CYP7B1	O75881	506 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	OR5F1	O95221	314 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	SNAP29	O95721	258 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	CLDN1	O95832	211 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	NPIPA8	P0DM63	369 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	TBXA2R	P21731	343 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	MMP11	P24347	488 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	IGFBP5	P24593	272 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	IFNGR2	P38484	337 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	CAPG	P40121	348 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	LIMS1	P48059	325 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	DAP	P51397	102 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	RPS6KA3	P51812	740 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	FOXL2	P58012	376 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	CHAF1B	Q13112	559 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	DGCR6	Q14129	220 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	FGFBP1	Q14512	234 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	SSPN	Q14714	243 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	EXT1	Q16394	746 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC36A3	Q495N2	470 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	PDZK1	Q5T2W1	519 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	FAHD1	Q6P587	224 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	RRM2B	Q7LG56	351 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ZAR1	Q86SH2	424 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF440	Q8IYI8	595 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF614	Q8N883	585 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	SLC38A4	Q969I6	547 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	C5orf34	Q96MH7	638 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ZNF570	Q96NI8	536 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	PSD2	Q9BQI7	771 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		11.3	□□□□□ -0.6
CIZ1-223	ENST00000491954	ING2	Q9H160	280 aa		11.3	□□□□□ -0.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms