RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472863.5

HOXB3-207, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,909 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-207ENST00000472863 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 IL22RA1Q8N6P7 574 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 NODALQ96S42 347 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 RASL10BQ96S79 203 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 GRIP2Q9C0E4 1043 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 ASCL3Q9NQ33 180 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 POFUT2Q9Y2G5 429 aa25.19■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 A0A1B0GWA3 101 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 CLK3P49761 638 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 Q0VFX4 171 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 NPRL3Q12980 569 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 TGIF1Q15583 401 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 KLHL17Q6TDP4 642 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 CADM2Q8N3J6 435 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 GATA6Q92908 595 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 KLHDC3Q9BQ90 382 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 MGAT4BQ9UQ53 548 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 EXPH5Q8NEV8 1989 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 H3BNH8 94 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 SLC16A6O15403 523 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 NDUFB5O43674 189 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 ITGAMP11215 1152 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 EFR3AQ14156 821 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF613Q6PF04 617 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 LSMEM1Q8N8F7 131 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 HGDQ93099 445 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 GPA33Q99795 319 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 TRIM2Q9C040 744 aa25.18■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 A0A0B4J2E0 115 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 A0A1B0GX12 115 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 A0A1W2PQD3 144 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 SCO2O43819 266 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 ITGA10O75578 1167 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 ANGPTL1O95841 491 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 ADAP00813 363 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 NAGAP17050 411 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 DTX1Q86Y01 620 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 SLC22A8Q8TCC7 542 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 NACC2Q96BF6 587 aa25.17■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 GMFGO60234 142 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 HPP00738 406 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 LINGO3P0C6S8 592 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF117Q03924 483 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 KRT80Q6KB66 452 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 C1orf94Q6P1W5 598 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 RRM2BQ7LG56 351 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 MRGPREQ86SM8 312 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 GABARAPL3Q9BY60 117 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 ADAM10O14672 748 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 CCR4P51679 360 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF440Q8IYI8 595 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 LINC00471Q8N535 108 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 ZNF524Q96C55 264 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 DGCR6LQ9BY27 220 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 UCK2Q9BZX2 261 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 LAT2Q9GZY6 243 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 CDCP1Q9H5V8 836 aa25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 HCRTR2O43614 444 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 PIP5K1CO60331 668 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 GFRA3O60609 400 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 FBXO45P0C2W1 286 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 CD82P27701 267 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 CHN2P52757 468 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 UGT2B15P54855 530 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 MYBPC1Q00872 1141 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 TMCO6Q96DC7 493 aa25.15■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 C2orf72A6NCS6 295 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 BCKDKO14874 412 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 ICAM2P13598 275 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 SOX3P41225 446 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 RPP38P78345 283 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 ALG10BQ5I7T1 473 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 NUP54Q7Z3B4 507 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 NRMQ8IXM6 262 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 OR10G3Q8NGC4 313 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 REV1Q9UBZ9 1251 aa25.14■■□□□ 1.62
HOXB3-207ENST00000472863 PCNX3Q9H6A9 2034 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 LYNP07948 512 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 IDH2P48735 452 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 RAPSNQ13702 412 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 ATP1A4Q13733 1029 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 BICRALQ6AI39 1079 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 PARP8Q8N3A8 854 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 SLC15A4Q8N697 577 aa25.14■■□□□ 1.61
HOXB3-207ENST00000472863 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.2 ms