RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471202.5

CHTF18-208, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, human

TSL 2

Gene CHTF18, Length 4,494 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHTF18-208	ENST00000471202		A0A0G2JNG1	304 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	HSFX4	A0A1B0GTS1	333 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	HSFX3	A0A1B0GWH4	333 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	TVP23A	A6NH52	213 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	KIR2DS3	K7RE56	304 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	MEN1	O00255	615 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	CPNE6	O95741	557 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	GP2	P55259	537 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	KIR2DS5	Q14953	304 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	SLC18B1	Q6NT16	456 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	RIMKLA	Q8IXN7	391 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	MLX	Q9UH92	298 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		13.57	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	DRD1	P21728	446 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	TATDN3	Q17R31	274 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	FAM3C	Q92520	227 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	NECTIN4	Q96NY8	510 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	13.56	□□□□□ -0.24	2e-8	■□□□□ 9.6
CHTF18-208	ENST00000471202	TXNL4B	Q9NX01	149 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	CLEC2D	Q9UHP7	191 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	SLC35A3	Q9Y2D2	325 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	CACNG2	Q9Y698	323 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	MAOB	P27338	520 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	SNTA1	Q13424	505 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	RAB11B	Q15907	218 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	ADO	Q96SZ5	270 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	BTBD2	Q9BX70	525 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	DUSP21	Q9H596	190 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	ZNF225	Q9UK10	706 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	C14orf166	Q9Y224	244 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	METTL15	A6NJ78	407 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	TEX46	H3BTG2	121 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	TP53I11	O14683	189 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	NFATC4	Q14934	902 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	PLK5	Q496M5	336 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	ADAMTSL4	Q6UY14	1074 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	TMEM179B	Q7Z7N9	219 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	NXPE3	Q969Y0	559 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	KLHL15	Q96M94	604 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	HMX3	A6NHT5	357 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	AQP9	O43315	295 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	NCR1	O76036	304 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	PNMT	P11086	282 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	CCNO	P22674	350 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	GABRA5	P31644	462 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	PRKX	P51817	358 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	HNRNPF	P52597	415 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	PDE7A	Q13946	482 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	SOWAHC	Q53LP3	525 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	SLX4IP	Q5VYV7	408 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	MMP21	Q8N119	569 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		13.56	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	PHYH	O14832	338 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	IDUA	P35475	653 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	UGT2B10	P36537	528 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	NKX3-2	P78367	333 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	ERV3-1	Q14264	604 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	ZNF385B	Q569K4	471 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	STX12	Q86Y82	276 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	OR13C3	Q8NGS6	347 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	ACER3	Q9NUN7	267 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	IRS1	P35568	1242 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	AGAP7P	Q5VUJ5	663 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	PLPP6	Q8IY26	295 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	GPR148	Q8TDV2	347 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	MR1	Q95460	341 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	LPAR4	Q99677	370 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	ZNF350	Q9GZX5	532 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	DKKL1	Q9UK85	242 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	NUP50	Q9UKX7	468 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	TRIP11	Q15643	1979 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		13.55	□□□□□ -0.24
CHTF18-208	ENST00000471202		H3BQ06	376 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24

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