RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469733.5

FAAP20-211, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 2,280 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-211ENST00000469733 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 CARFQ8N187 725 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 BCORP1Q8N888 145 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF615Q8N8J6 731 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 YIPF2Q9BWQ6 316 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 ASPNQ9BXN1 380 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 SSR3Q9UNL2 185 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 PCDH15Q96QU1 1955 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 TMEM150CB9EJG8 249 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 BHLHE40O14503 412 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 LIMS3P0CW19 117 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 LIMS4P0CW20 117 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 TBXA2RP21731 343 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 CD40LGP29965 261 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 RBM34P42696 430 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 CXCL12P48061 93 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 PPP5CP53041 499 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 WDR45BQ5MNZ6 344 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 TTLL10Q6ZVT0 673 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 CPOQ8IVL8 374 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 GID4Q8IVV7 300 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 CMIPQ8IY22 773 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 LSMEM1Q8N8F7 131 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 BBS1Q8NFJ9 593 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 OR13C2Q8NGS9 318 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 ISYNA1Q9NPH2 558 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 GMEB2Q9UKD1 530 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 PEX16Q9Y5Y5 336 aa15.84■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 C17orf105B2RV13 164 aa15.83■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 TAF4O00268 1085 aa15.83■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 DUX1O43812 170 aa15.83■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 ADAM11O75078 769 aa15.83■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 DSG2Q14126 1118 aa15.83■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 ALG10BQ5I7T1 473 aa15.83■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 SMARCD3Q6STE5 483 aa15.83■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 LAPTM4BQ86VI4 370 aa15.83■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 PLXDC1Q8IUK5 500 aa15.83■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 LNX2Q8N448 690 aa15.83■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 OR7G1Q8NGA0 311 aa15.83■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 OTULINQ96BN8 352 aa15.83■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 FN3KQ9H479 309 aa15.83■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 LANCL2Q9NS86 450 aa15.83■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 DAPK2Q9UIK4 370 aa15.83■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 SIGLEC7Q9Y286 467 aa15.83■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP15.83■□□□□ 0.13
FAAP20-211ENST00000469733 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa15.83■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 ANKRD33BA6NCL7 494 aa15.83■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 HCN1O60741 890 aa15.83■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 CLPSP04118 112 aa15.83■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 ALAS2P22557 587 aa15.83■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 SLC1A3P43003 542 aa15.83■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 PERM1Q5SV97 790 aa15.83■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 OR4F15Q8NGB8 312 aa15.83■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 GATAD2BQ8WXI9 593 aa15.83■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF426Q9BUY5 554 aa15.83■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 NUAK2Q9H093 628 aa15.83■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa15.83■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 MMACHCQ9Y4U1 282 aa15.83■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 EML5Q05BV3 1969 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 FAM86C2PA6NEL3 165 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 FAM183AA6NL82 134 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 H3BMH7 237 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 SOCS6O14544 535 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 ATP6V1E1P36543 226 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 OR1D4P47884 311 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 IFITM3Q01628 133 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 TRIM16LQ309B1 348 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 PLBD1Q6P4A8 553 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 SNX29P2Q8IUI4 249 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 SLC35F3Q8IY50 421 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 CADM2Q8N3J6 435 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 PSD4Q8NDX1 1056 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 UFD1Q92890 307 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 MVB12AQ96EY5 273 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 IFT27Q9BW83 186 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 ENKD1Q9H0I2 346 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 SIAEQ9HAT2 523 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 A0A1B0GVT2 93 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 A0A1W2PPC1 479 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 SERINC4A6NH21 518 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 K7ESF4 209 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 RFPL3O75679 317 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 CSTAP01040 98 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 GLB1P16278 677 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 SNAP47Q5SQN1 464 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 ULK3Q6PHR2 472 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 LHFPL3Q86UP9 236 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 SLC25A45Q8N413 288 aa15.82■□□□□ 0.12
FAAP20-211ENST00000469733 TM9SF4Q92544 642 aa15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.4 ms