RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466636.1

SRPRB-202, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene SRPRB, Length 917 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-202ENST00000466636 LSMEM1Q8N8F7 131 aa8.76□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF527Q8NB42 609 aa8.76□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 TSPAN14Q8NG11 270 aa8.76□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 PIGXQ8TBF5 258 aa8.76□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa8.76□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM255BQ8WV15 326 aa8.76□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 ARSGQ96EG1 525 aa8.76□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 ADOQ96SZ5 270 aa8.76□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 TRIM2Q9C040 744 aa8.76□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF700Q9H0M5 742 aa8.76□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM27Q9HBJ8 222 aa8.76□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 A0A1W2PQD3 144 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 OR6C70A6NIJ9 312 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 ALG1L2C9J202 215 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 SLC1A7O00341 560 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 SCDO00767 359 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 ADAM10O14672 748 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 CHP2O43745 196 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 PPM1BO75688 479 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 TFAP2AP05549 437 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 RAB40ALP0C0E4 278 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 UBL4AP11441 157 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 CDK4P11802 303 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 COX6A1P12074 109 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 GABRB1P18505 474 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 GSTM3P21266 225 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 CRHBPP24387 322 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 FPR3P25089 353 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 KRT20P35900 424 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 FOLR3P41439 243 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 HLCSP50747 726 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 CDH15P55291 814 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 TSPAN31Q12999 210 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 KIRREL2Q6UWL6 708 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 KIF18BQ86Y91 864 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 NRMQ8IXM6 262 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 ENTHD1Q8IYW4 607 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 GATSQ8NAP1 163 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 POGLUT1Q8NBL1 392 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 DEFB124Q8NES8 71 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 OR5L2Q8NGL0 311 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 CNIH3Q8TBE1 160 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 ELP5Q8TE02 316 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 CT55Q8WUE5 264 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 RNF138Q8WVD3 245 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 APH1BQ8WW43 257 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 UBE2FQ969M7 185 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF566Q969W8 418 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 IMMP1LQ96LU5 166 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF426Q9BUY5 554 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 RTN4RQ9BZR6 473 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 ZNF226Q9NYT6 803 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 FOXJ2Q9P0K8 574 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 PADI1Q9ULC6 663 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 RNF6Q9Y252 685 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa8.75□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 SOCS6O14544 535 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 FADS1O60427 444 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 WBP4O75554 376 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 ZFAND5O76080 213 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 OR6B1O95007 311 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 SOX14O95416 240 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 CLPTM1O96005 669 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 IGHEP01854 428 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 CD63P08962 238 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 CCDC159P0C7I6 412 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 HPGDP15428 266 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 NAGAP17050 411 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 STAT5AP42229 794 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 CXCR4P61073 352 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 TUBA4AP68366 448 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 TEKQ02763 1124 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 PRKCDQ05655 676 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM236Q5W0B7 351 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 C12orf73Q69YU5 71 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 CBLN3Q6UW01 205 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 LINC00114Q6XXX2 140 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 RHOXF1Q8NHV9 184 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 FAM81AQ8TBF8 368 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 GRHL3Q8TE85 626 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 TMEM239Q8WW34 195 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 HGDQ93099 445 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 MPP4Q96JB8 637 aa8.74□□□□□ -1.01
SRPRB-202ENST00000466636 LAT2Q9GZY6 243 aa8.74□□□□□ -1.01
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