RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APEX1P27695 318 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC7A1P30825 629 aa14.5□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LGALS3BPQ08380 585 aa14.5□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FOXF1Q12946 379 aa14.5□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MLC1Q15049 377 aa14.5□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MST1LQ2TV78 715 aa14.5□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBE2J2Q8N2K1 259 aa14.5□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR151Q8TDV0 419 aa14.5□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C16orf78Q8WTQ4 265 aa14.5□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PHF21BQ96EK2 531 aa14.5□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COQ10BQ9H8M1 238 aa14.5□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GXYLT2A0PJZ3 443 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPIPA7E9PJI5 369 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYTIPO60759 359 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFI6P09912 130 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPIPA8P0DM63 369 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EDNRAP25101 427 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GIFP27352 417 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NTSP30990 170 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LCN1P31025 176 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LIMS1P48059 325 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CDH15P55291 814 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPIN4Q56A73 249 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 USP43Q70EL4 1123 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC46A3Q7Z3Q1 461 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PIK3R3Q92569 461 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ELP4Q96EB1 424 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 JMJD8Q96S16 334 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRIM31Q9BZY9 425 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UBQLN4Q9NRR5 601 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAS2R16Q9NYV7 291 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDHB10Q9UN67 800 aa14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1W2PQD3 144 aa14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C9JVG2 144 aa14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCDO00767 359 aa14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMPRSS2O15393 492 aa14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EFNA2O43921 213 aa14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STAMBPO95630 424 aa14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDCP20711 480 aa14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRIM2P49643 509 aa14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NAB1Q13506 487 aa14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ACSM2BQ68CK6 577 aa14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LETMD1Q6P1Q0 360 aa14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OR6Y1Q8NGX8 325 aa14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXO27Q8NI29 283 aa14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MUS81Q96NY9 551 aa14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GPR78Q96P69 363 aa14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SAP130Q9H0E3 1048 aa14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ASB6Q9NWX5 421 aa14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EMC3Q9P0I2 261 aa14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1W2PR80 420 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NKX2-2O95096 273 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NUDT14O95848 222 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRT6AP02538 564 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRT6BP04259 564 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRT6CP48668 564 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HILS1P60008 231 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAE1P78406 368 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SELENBP1Q13228 472 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TECRLQ5HYJ1 363 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SHISA2Q6UWI4 295 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GLCCI1Q86VQ1 547 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KLHL7Q8IXQ5 586 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LRRC17Q8N6Y2 441 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKS4BQ8N8V4 417 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APH1AQ96BI3 265 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB1BQ9H0U4 201 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MIEF1Q9NQG6 463 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAS2R7Q9NYW3 318 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNX12Q9UMY4 172 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRAF6Q9Y4K3 522 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ACTL7BQ9Y614 415 aa14.47□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A096LPK6 155 aa14.46□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 B4DSR2 109 aa14.46□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LILRA1O75019 489 aa14.46□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMIM24O75264 130 aa14.46□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RBP1P09455 135 aa14.46□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRPS2P11908 318 aa14.46□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL2RGP31785 369 aa14.46□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SERPINF1P36955 418 aa14.46□□□□□ -0.09
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms