RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422939.1

TRPS1-204, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2

Gene TRPS1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-204ENST00000422939 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
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TRPS1-204ENST00000422939 IDSP22304 550 aa3.55□□□□□ -1.84
TRPS1-204ENST00000422939 METAP1P53582 386 aa3.55□□□□□ -1.84
TRPS1-204ENST00000422939 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
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TRPS1-204ENST00000422939 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
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TRPS1-204ENST00000422939 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.55□□□□□ -1.84
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TRPS1-204ENST00000422939 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.55□□□□□ -1.84
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TRPS1-204ENST00000422939 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa3.55□□□□□ -1.84
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TRPS1-204ENST00000422939 CHRNA9Q9UGM1 479 aa3.55□□□□□ -1.84
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TRPS1-204ENST00000422939 FAM231BA6NCW3 169 aa3.54□□□□□ -1.84
TRPS1-204ENST00000422939 MFSD2BA6NFX1 497 aa3.54□□□□□ -1.84
TRPS1-204ENST00000422939 NPIPA2E9PIF3 369 aa3.54□□□□□ -1.84
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TRPS1-204ENST00000422939 ALPIP09923 528 aa3.53□□□□□ -1.84
TRPS1-204ENST00000422939 IQCF3P0C7M6 154 aa3.53□□□□□ -1.84
TRPS1-204ENST00000422939 PPIAL4GP0DN37 164 aa3.53□□□□□ -1.84
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF44P15621 663 aa3.53□□□□□ -1.84
TRPS1-204ENST00000422939 ZNF17P17021 662 aa3.53□□□□□ -1.84
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