RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 HHATLQ9HCP6 504 aa16.95■□□□□ 0.3
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HOXD12-201ENST00000404162 TMEM151AQ8N4L1 468 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 CDRT4Q8N9R6 151 aa16.9■□□□□ 0.3
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HOXD12-201ENST00000404162 FBXO25Q8TCJ0 367 aa16.9■□□□□ 0.3
HOXD12-201ENST00000404162 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa16.9■□□□□ 0.3
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