RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 ETV6P41212 452 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 GPR143P51810 404 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 ZNF136P52737 540 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 LTBQ06643 244 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 TAZQ16635 292 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 RNF151Q2KHN1 245 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 PM20D1Q6GTS8 502 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 VITQ6UXI7 678 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 PRSS42Q7Z5A4 293 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 CPA6Q8N4T0 437 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 CLRN3Q8NCR9 226 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 YIPF6Q96EC8 236 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 UBXN10Q96LJ8 280 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 PIGMQ9H3S5 423 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 C1GALT1Q9NS00 363 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 GPR39O43194 453 aa9.22□□□□□ -0.93
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HERC3-202ENST00000402738 PFKMP08237 780 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 ACY1Q03154 408 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 PGGHGQ32M88 737 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 ZMAT1Q5H9K5 638 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 ZBTB37Q5TC79 503 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 GPR148Q8TDV2 347 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 PRRC1Q96M27 445 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SAMD10Q9BYL1 202 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SPNS1Q9H2V7 528 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 ASH2LQ9UBL3 628 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 REV1Q9UBZ9 1251 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SLC23A1Q9UHI7 598 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 CBY1Q9Y3M2 126 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 RHOP08100 348 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 CSF3P09919 207 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 ARAFP10398 606 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 HCCSP53701 268 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 PER3P56645 1201 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 FXYD4P59646 89 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 MEF2DQ14814 521 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 EBPQ15125 230 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SLC9A3R2Q15599 337 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 CTF1Q16619 201 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 C9orf131Q5VYM1 1079 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 TRNP1Q6NT89 227 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 UNC5DQ6UXZ4 953 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 LIX1LQ8IVB5 337 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 NPLOC4Q8TAT6 608 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 INTS14Q96SY0 518 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 TMEM175Q9BSA9 504 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SLC12A9Q9BXP2 914 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SLC19A3Q9BZV2 496 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 DUSP21Q9H596 190 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SLC6A20Q9NP91 592 aa9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 GMEB2Q9UKD1 530 aa9.22□□□□□ -0.93
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HERC3-202ENST00000402738 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SOCS7O14512 581 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 ZNF195O14628 629 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SLC16A8O95907 504 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 S100A8P05109 93 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 F3P13726 295 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 BPIP17213 487 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 GPR17Q13304 367 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SGPP2Q8IWX5 399 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 OR4N5Q8IXE1 308 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 OR2T4Q8NH00 348 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SH3RF2Q8TEC5 729 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 OVCA2Q8WZ82 227 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 C1orf226A1L170 272 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SHOXO15266 292 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 CYTIPO60759 359 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 DNAJB6O75190 326 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 RDH16O75452 317 aa9.21□□□□□ -0.93
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HERC3-202ENST00000402738 MTNR1BP49286 362 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 SQSTM1Q13501 440 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZSR9 355 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 PRSS45Q7RTY3 260 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 NAA40Q86UY6 237 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 OR1M1Q8NGA1 313 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 OR52I1Q8NGK6 324 aa9.21□□□□□ -0.93
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HERC3-202ENST00000402738 OR6N1Q8NGY5 312 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 CRYGNQ8WXF5 182 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 RAB40AQ8WXH6 277 aa9.21□□□□□ -0.93
HERC3-202ENST00000402738 GPR78Q96P69 363 aa9.21□□□□□ -0.93
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