RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDC25BP30305 580 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 RBMXP38159 391 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 FOXA1P55317 472 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 TUBA1BP68363 451 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 TUBA4AP68366 448 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 DR1Q01658 176 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLAURQ03405 335 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 BTKQ06187 659 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 IFT88Q13099 833 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 ACAP2Q15057 778 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 GABRA6Q16445 453 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 DUSP5Q16690 384 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 DECR1Q16698 335 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 IQCCQ4KMZ1 466 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 TUBA1AQ71U36 451 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 PEG10Q86TG7 708 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 CREG2Q8IUH2 290 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 SVOPLQ8N434 492 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 CDYL2Q8N8U2 506 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 RHEBL1Q8TAI7 183 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM110BQ8TC76 370 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 FBF1Q8TES7 1133 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZFP90Q8TF47 636 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 ATP6V1E2Q96A05 226 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZBTB8AQ96BR9 441 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 ELP4Q96EB1 424 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 RADILQ96JH8 1075 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 EGLN2Q96KS0 407 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 AMDHD1Q96NU7 426 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 HDHD5Q9BXW7 423 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 ELOVL6Q9H5J4 265 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 NGBQ9NPG2 151 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 TAS2R9Q9NYW1 312 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 SENP1Q9P0U3 644 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 NTMQ9P121 344 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 MCM8Q9UJA3 840 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 SNX12Q9UMY4 172 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 MOKQ9UQ07 419 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 TIMM22Q9Y584 194 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 KCNE3Q9Y6H6 103 aa4.71□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 LOC105371242A0A075B767 164 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A087WZY1 265 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 A0A0G2JK05 382 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 SERINC4A6NH21 518 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 KLF11O14901 512 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 RGS14O43566 566 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 COQ9O75208 318 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRKD3O94806 890 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 NKX2-2O95096 273 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 KLHL2O95198 593 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 TACSTD2P09758 323 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 CSF3P09919 207 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADRA2CP18825 462 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 CALCRP30988 508 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPRP35270 261 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAGEA12P43365 314 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 ASMTP46597 345 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 PHC1P78364 1004 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 C2orf80Q0P641 193 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 HSPB3Q12988 150 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC29A2Q14542 456 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 MLC1Q15049 377 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 HIKESHIQ53FT3 197 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 UNC50Q53HI1 259 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 GRTP1Q5TC63 336 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM71E1Q6IPT2 247 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZNF544Q6NX49 715 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 VHLLQ6RSH7 139 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZDHHC24Q6UX98 284 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM108Q6UXF1 575 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 LINGO2Q7L985 606 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 SPATA19Q7Z5L4 167 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC103Q8IW40 242 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZDHHC22Q8N966 263 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 LINC01356Q8N9X3 169 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 SGMS2Q8NHU3 365 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPR151Q8TDV0 419 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 GPR119Q8TDV5 335 aa4.7□□□□□ -1.66
RNU6-171P-201ENST00000384354 PYROXD1Q8WU10 500 aa4.7□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms