RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366365.2

SNHG20-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 20, humanhuman

TSL 2

Gene SNHG20, Length 1,028 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG20-201ENST00000366365 PNLIPRP2P54317 469 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 CDH13P55290 713 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 FGFBP1Q14512 234 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 IMPG1Q17R60 797 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 DCHS2Q6V1P9 2916 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 IFNEQ86WN2 208 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 FAM9CQ8IZT9 166 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 FITM2Q8N6M3 262 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 NAXEQ8NCW5 288 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 OR52R1Q8NGF1 315 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 OR14L1PQ8NHC6 308 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 ZFP28Q8NHY6 868 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 BTBD9Q96Q07 612 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 BBS4Q96RK4 519 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 FOXC2Q99958 501 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 SFXN3Q9BWM7 321 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 ITPAQ9BY32 194 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 MIEF1Q9NQG6 463 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 PLLPQ9Y342 182 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 OR10H1Q9Y4A9 318 aa9.52□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 SPG11Q96JI7 2443 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 WASHC1A8K0Z3 465 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 H0Y3Z8 333 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 DYNC1I1O14576 645 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 RIPK2O43353 540 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 ICOSLGO75144 302 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 GLRA3O75311 464 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 CRHP06850 196 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 IFI6P09912 130 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 NTSP30990 170 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 PCYT1AP49585 367 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 EMDP50402 254 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 ART1P52961 327 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 ZNF763Q0D2J5 394 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 GANABQ14697 944 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 BCL2A1Q16548 175 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 CCDC153Q494R4 210 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 CFAP157Q5JU67 520 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 SPDYAQ5MJ70 313 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 OR2A2Q6IF42 318 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 TMEM64Q6YI46 380 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 IKBIPQ70UQ0 350 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 DOK3Q7L591 496 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 PLCZ1Q86YW0 608 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 RDH11Q8TC12 318 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 HGDQ93099 445 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 WDYHV1Q96HA8 205 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 ZNF681Q96N22 645 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 TRIB1Q96RU8 372 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 UGT2B28Q9BY64 529 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 OR2B2Q9GZK3 357 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 PTGES2Q9H7Z7 377 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 MSL2Q9HCI7 577 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 RASSF1Q9NS23 344 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 TAS2R10Q9NYW0 307 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 TAS2R7Q9NYW3 318 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 PDZD2O15018 2839 aa9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 UQCRHLA0A096LP55 91 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 A0A1W2PRX2 142 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 A6NNC1 897 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 CASKO14936 926 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 SLU7O95391 586 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 IL3P08700 152 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 TMIGD3P0DMS9 266 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 MYL2P10916 166 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 DGKQP52824 942 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 PTTG1IPP53801 180 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 KRTAP10-9P60411 292 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 HMGCS1Q01581 520 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 CEBPEQ15744 281 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 DECR1Q16698 335 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 VPS26BQ4G0F5 336 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 UNC50Q53HI1 259 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 ZNF628Q5EBL2 1059 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 FNDC7Q5VTL7 733 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 FAM111BQ6SJ93 734 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 KRT73Q86Y46 540 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 PRR22Q8IZ63 422 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 TNIP2Q8NFZ5 429 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 DOK4Q8TEW6 326 aa9.5□□□□□ -0.89
SNHG20-201ENST00000366365 C16orf78Q8WTQ4 265 aa9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.3 ms