RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331163.10

PDGFB-201, Transcript of platelet derived growth factor subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFB, Length 3,497 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFB-201ENST00000331163 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 NDUFAF4Q9P032 175 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 FBXO4Q9UKT5 387 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 CENPXA8MT69 81 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 TRAPPC6AO75865 159 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 RETP07949 1114 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 NRG3P56975 720 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 SNAPC1Q16533 368 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 MAPK14Q16539 360 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 SAXO2Q658L1 398 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 OGFOD3Q6PK18 319 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 SLC2A12Q8TD20 617 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 SDF2Q99470 211 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 PLXNA2O75051 1894 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 DOCK7Q96N67 2140 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 C11orf98E9PRG8 122 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 STK17BO94768 372 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 GIMD1P0DJR0 217 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 RBBP4Q09028 425 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 SNTA1Q13424 505 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 NAXDQ8IW45 347 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 OR4K5Q8NGD3 323 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 KLHL6Q8WZ60 621 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 CALML5Q9NZT1 146 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa14.69□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 CACNA1AO00555 2505 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 SLC25A12O75746 678 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 CCKBRP32239 447 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 DEFA1P59665 94 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 DEFA3P59666 94 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 RPS15P62841 145 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 FAM53BQ14153 422 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 SPANXN2Q5MJ10 180 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 DUSP19Q8WTR2 217 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 LYRM4Q9HD34 91 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 CBLCQ9ULV8 474 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 FPR1P21462 350 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 PCMT1P22061 227 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 VEZF1Q14119 521 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 OTPQ5XKR4 325 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 NATD1Q8N6N6 113 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 PIP5K1AQ99755 562 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 ZNF160Q9HCG1 818 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 PTGFRNQ9P2B2 879 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 ENPP4Q9Y6X5 453 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 DCDC2BA2VCK2 349 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 SMIM30A4D0T7 59 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 FLRT2O43155 660 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 KCNJ10P78508 379 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 PRTGQ2VWP7 1150 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 ARMC4Q5T2S8 1044 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 LCN10Q6JVE6 187 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 MARCH3Q86UD3 253 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 STX19Q8N4C7 294 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 DPH1Q9BZG8 443 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 AKAP6Q13023 2319 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 DMXL1Q9Y485 3027 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 LIPAP38571 399 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 SERTAD2Q14140 314 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 ZNF691Q5VV52 312 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 SHFQ7M4L6 423 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 ZNF605Q86T29 641 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 VASH2Q86V25 355 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 NUDT9Q9BW91 350 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 OR51E2Q9H255 320 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 SHISA8B8ZZ34 492 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 BMP7P18075 431 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 PPP2R2BQ00005 443 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 CCDC58Q4VC31 144 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 NKAIN4Q8IVV8 208 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 TM4SF19Q96DZ7 209 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 ZNF681Q96N22 645 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa14.67□□□□□ -0.06
PDGFB-201ENST00000331163 GALNT9Q9HCQ5 603 aa14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.7 ms