RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320580.8

PACS1-201, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACS1, Length 4,392 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-201ENST00000320580 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 COMMD2Q86X83 199 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 STEAP2Q8NFT2 490 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 IL26Q9NPH9 171 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 DUSP28Q4G0W2 176 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 MPPE1Q53F39 396 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 HORMAD2Q8N7B1 307 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 TIFAQ96CG3 184 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 MICU1Q9BPX6 476 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 GKN3PP0CG01 181 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 PPT1P50897 306 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 RAB41Q5JT25 222 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 CXorf40BQ96DE9 158 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 FTSJ1Q9UET6 329 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 TRIM77I1YAP6 450 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 HPGDP15428 266 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 CD9P21926 228 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 CPT2P23786 658 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 AOAHP28039 575 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 CSF2RBP32927 897 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 MVDP53602 400 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 ZNF585AQ6P3V2 769 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 OR52B4Q8NGK2 314 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 SLC38A5Q8WUX1 472 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 GHSRQ92847 366 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 CST11Q9H112 138 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 ATG5Q9H1Y0 275 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa15.57■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 GXYLT2A0PJZ3 443 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 PTGESO14684 152 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 LANCL1O43813 399 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 EGFP01133 1207 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 HPXP02790 462 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 GRPRP30550 384 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 RGS19P49795 217 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 SP140Q13342 867 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 MAPK14Q16539 360 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 TMEM107Q6UX40 140 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 NUDT13Q86X67 352 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 ABHD1Q96SE0 405 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 MCRIP1C9JLW8 97 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 SCN2BO60939 215 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 RPN2P04844 631 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 GYPBP06028 91 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 ACTC1P68032 377 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 ACTA1P68133 377 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 ACVR1Q04771 509 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 BIKQ13323 160 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 RIN1Q13671 783 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 SYPL1Q16563 259 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 ZNF674Q2M3X9 581 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 Q3ZCU0 254 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 C14orf28Q4W4Y0 310 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 LRRTM3Q86VH5 581 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 SCMH1Q96GD3 660 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 UROC1Q96N76 676 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 HRASLSQ9HDD0 168 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 NKPD1Q17RQ9 610 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 DPPA2Q7Z7J5 298 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 JAZF1Q86VZ6 243 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 SLC6A7Q99884 636 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 ZNF649Q9BS31 505 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 DPH7Q9BTV6 452 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 GAREM1Q9H706 876 aa15.56■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 UNC119BA6NIH7 251 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 HEPACAM2A8MVW5 462 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 INHAP05111 366 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 NMBP08949 121 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 PSMB10P40306 273 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 OR2B8PP59922 312 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 KIAA0040Q15053 153 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 KIAA1211LQ6NV74 962 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 TMEM205Q6UW68 189 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 DPPA4Q7L190 304 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 KCT2Q8NC54 265 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 SLC6A16Q9GZN6 736 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 ZFP64Q9NPA5 681 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 PSMD9O00233 223 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 RAB3DO95716 219 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 AKR1A1P14550 325 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 PRSS3P35030 304 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 PRKCZQ05513 592 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 PGGHGQ32M88 737 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 ZNF565Q8N9K5 539 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 SMPDL3BQ92485 455 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 SEMA4CQ9C0C4 833 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 PTPRFP10586 1907 aa15.55■□□□□ 0.08
PACS1-201ENST00000320580 WNT1P04628 370 aa15.55■□□□□ 0.08
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