RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000268049.11

USP3-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3, Length 5,311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-201ENST00000268049 SVBPQ8N300 66 aa7.35□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 OR2T35Q8NGX2 323 aa7.35□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 BBS10Q8TAM1 723 aa7.35□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 ZNF675Q8TD23 568 aa7.35□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 LRRC58Q96CX6 371 aa7.35□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 CHFRQ96EP1 664 aa7.35□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 NEDD4LQ96PU5 975 aa7.35□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 VPS25Q9BRG1 176 aa7.35□□□□□ -1.23
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USP3-201ENST00000268049 ARL6IP5O75915 188 aa7.35□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 FTH1P19P0C7X4 201 aa7.35□□□□□ -1.23
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USP3-201ENST00000268049 KLRB1Q12918 225 aa7.35□□□□□ -1.23
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USP3-201ENST00000268049 PGAM5Q96HS1 289 aa7.35□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 IL4I1Q96RQ9 567 aa7.35□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 EBPLQ9BY08 206 aa7.35□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 ELOVL3Q9HB03 270 aa7.35□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 GLTPQ9NZD2 209 aa7.35□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 ABRACLQ9P1F3 81 aa7.35□□□□□ -1.23
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USP3-201ENST00000268049 A6NIZ1 184 aa7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 PDGFAP04085 211 aa7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 GABRA1P14867 456 aa7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 SELEP16581 610 aa7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 RAB4AP20338 218 aa7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 ADH7P40394 386 aa7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 MAP2K4P45985 399 aa7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 RAP1BP61224 184 aa7.34□□□□□ -1.23
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USP3-201ENST00000268049 IL11RAQ14626 422 aa7.34□□□□□ -1.23
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USP3-201ENST00000268049 OR2T5Q6IEZ7 315 aa7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 SMRP1Q8NCR6 262 aa7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 OR2T29Q8NH02 315 aa7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 ELMOD3Q96FG2 381 aa7.34□□□□□ -1.23
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USP3-201ENST00000268049 PKP4Q99569 1192 aa7.34□□□□□ -1.23
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USP3-201ENST00000268049 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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USP3-201ENST00000268049 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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USP3-201ENST00000268049 AP1G1O43747 822 aa7.34□□□□□ -1.23
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USP3-201ENST00000268049 GABARAPL2P60520 117 aa7.34□□□□□ -1.23
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USP3-201ENST00000268049 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 CARD17Q5XLA6 110 aa7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 MED25Q71SY5 747 aa7.34□□□□□ -1.23
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USP3-201ENST00000268049 OR4N5Q8IXE1 308 aa7.34□□□□□ -1.23
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USP3-201ENST00000268049 TBC1D20Q96BZ9 403 aa7.34□□□□□ -1.23
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USP3-201ENST00000268049 OCEL1Q9H607 264 aa7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 CHST11Q9NPF2 352 aa7.34□□□□□ -1.23
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USP3-201ENST00000268049 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
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USP3-201ENST00000268049 IHHQ14623 411 aa7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 BEST3Q8N1M1 668 aa7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 PQLC3Q8N755 202 aa7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 SLC35B2Q8TB61 432 aa7.34□□□□□ -1.23
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USP3-201ENST00000268049 SPO11Q9Y5K1 396 aa7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP3-201ENST00000268049 OR2T1O43869 369 aa7.34□□□□□ -1.24
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