RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000047793.5

Hoxd1-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd1, Length 1,862 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dus3lQ91XI1 637 aaKnown RBP19.34■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pskh1Q91YA2 424 aa19.34■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Chp2Q9D869 196 aa19.34■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Emc7Q9EP72 241 aa19.34■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lgi1Q9JIA1 557 aa19.34■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sars2Q9JJL8 518 aa19.34■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Alx4O35137 399 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pld3O35405 488 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Best1O88870 551 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zfp28P10078 825 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 IgfalsP70389 603 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dgcr2P98154 548 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rnf44Q3UHJ8 407 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nr2f1Q60632 422 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ubfd1Q78JW9 368 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tas2r104Q7M723 302 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Znf775Q8BI73 538 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NdnfQ8C119 568 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gpr158Q8C419 1200 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nmral1Q8K2T1 309 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CipcQ8R0W1 432 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Irf2bp1Q8R3Y8 584 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1461Q8VEV7 312 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr1414Q8VGU5 312 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 CrebzfQ91ZR3 358 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Adarb1Q91ZS8 711 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SmoxQ99K82 555 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Krt88Q9CPR6 171 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Khdc3Q9CWU5 440 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 3110001I22RikQ9CZ70 312 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Osbpl3Q9DBS9 855 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tsga8Q9JJL0 238 aa19.33■□□□□ 0.69
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 RerglB2RVE2 204 aa19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Serpina3jD3Z451 420 aa19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Zw10O54692 779 aa19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tcea1P10711 301 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 HgfQ08048 728 aa19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MlanaQ2TA50 113 aa19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 B3gnt6Q3USF0 391 aa19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fut10Q5F2L2 481 aa19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tbccd1Q640P7 552 aa19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Adamtsl2Q7TSK7 957 aa19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ticam1Q80UF7 732 aa19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Efcab3Q80X60 432 aa19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Mblac2Q8BL86 279 aa19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cadm2Q8BLQ9 435 aa19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Eif4e2Q8BMB3 245 aaKnown RBP19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lats1Q8BYR2 1129 aa19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Serpina11Q8CIE0 424 aa19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sh3glb2Q8R3V5 400 aa19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Slc22a6Q8VC69 545 aa19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr380Q8VGT3 311 aa19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Asb16Q8VHS5 453 aa19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rnf144aQ925F3 292 aa19.33■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm28557A0A087WQQ0 336 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dcst2A0A140LIJ0 701 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Fnd3c2A2AP83 941 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm5475D3YV11 175 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr640E9Q7P5 314 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm6576F6YTZ4 274 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Arl9F7BE40 171 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 S100a2J3QMC7 104 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Kif1cO35071 1100 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nhlh1Q02576 133 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 MamstrQ0ZCJ7 421 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Q3U7U4 132 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Itpripl2Q3UV16 535 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Nlrc3Q5DU56 1064 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ttf1Q62187 859 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vat1Q62465 406 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Sohlh1Q6IUP1 357 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Rcbtb1Q6NXM2 531 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pced1aQ6P1Z5 449 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AptxQ7TQC5 342 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 AasdhQ80WC9 1100 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Coq9Q8K1Z0 313 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 DctdQ8K2D6 178 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Lipt1Q8VCM4 373 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Erlec1Q8VEH8 483 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Olfr572Q8VGZ3 318 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Laptm4bQ91XQ6 227 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Pcdhgb5Q91XX5 926 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Tssk6Q925K9 273 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 SdhcQ9CZB0 169 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Vmn1r52Q9EP79 309 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Aldh9a1Q9JLJ2 494 aa19.32■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm5141A0A0J9YUW3 581 aa19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Srp54bE9PXC0 504 aa19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ms4a7E9Q9V5 267 aa19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 2610001J05RikF2Z3Y9 59 aa19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Prr22F6TNE3 422 aa19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gm1110F6Y113 635 aa19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Foxd2O35392 492 aa19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Ppt2O35448 302 aa19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 NlkO54949 527 aa19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 FasP25446 327 aa19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Gsx2P31316 305 aa19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Cav3P51637 151 aa19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1700066B19RikQ3TS39 127 aa19.31■□□□□ 0.68
Hoxd1-201ENSMUST00000047793 Dag1Q62165 893 aa19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.9 ms