RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dmxl1Q6PNC0 3013 aa10.9□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1555-ps1A0A140LHT7 321 aa10.9□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 ItpkbB2RXC2 942 aa10.9□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Phox2bO35690 314 aa10.9□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nkx2-2P42586 273 aa10.9□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Copz1P61924 177 aa10.9□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Srsf6Q3TWW8 339 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Amigo2Q80ZD9 519 aa10.9□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mtg1Q8R2R6 326 aa10.9□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dus3lQ91XI1 637 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rmnd5bQ91YQ7 393 aa10.9□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Uts2Q9QZQ3 123 aa10.9□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bcl10Q9Z0H7 233 aa10.9□□□□□ -0.66
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm44973A0A140LJJ1 189 aa10.9□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 TriqkB2B9E1 86 aa10.9□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn2r90E9PXJ8 863 aa10.9□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm17093F6XGJ4 214 aa10.9□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cldn34aG3UW52 211 aa10.9□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hsd17b10O08756 261 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Col10a1Q05306 680 aa10.9□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Klri2Q5DT36 248 aa10.9□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pik3c3Q6PF93 887 aa10.9□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nlgn3Q8BYM5 825 aa10.9□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lin52Q8CD94 116 aa10.9□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bcl2l14Q9CPT0 328 aa10.9□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 DenrQ9CQJ6 198 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gtpbp8Q9CY28 285 aa10.9□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 PaicsQ9DCL9 425 aa10.9□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Il36aQ9JLA2 160 aa10.9□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 CtsjQ9R014 334 aa10.9□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc25a43A2A3V2 341 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 SmoktcrA2KF29 484 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Esp22A8R0V4 111 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr653E9PVA0 317 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm10639E9Q6L7 222 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm5407E9Q7Q1 248 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Taf1aP97357 453 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wfdc5Q4KXB6 126 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Magee2Q52KG3 523 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ppp2r2bQ6ZWR4 443 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tas2r140Q7TQA4 312 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Abhd13Q80UX8 337 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmem251Q8BH26 163 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prpf18Q8BM39 342 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ckap4Q8BMK4 575 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Clec4gQ8BNX1 294 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cxcl16Q8BSU2 246 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 GatcQ8CBY0 155 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc80Q8R2G6 949 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pcolce2Q8R4W6 414 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr1047Q8VGS0 319 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp810Q99K45 461 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rcc1lQ9CYF5 461 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tcf7l1Q9Z1J1 584 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrr1D3YY91 422 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 PigfO09101 219 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wnt11P48615 354 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gnb5P62881 395 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rgs14P97492 547 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 JupQ02257 745 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dnal1Q05A62 190 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 MplQ08351 625 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 MitfQ08874 526 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc25a21Q8BZ09 298 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r81Q8R286 306 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Satb2Q8VI24 733 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Q9CQM1 111 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Snx20Q9D2Y5 313 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 4933436I01RikQ9D3T1 429 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 MycbpQ9EQS3 103 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 SigirrQ9JLZ8 409 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prss16Q9QXE5 509 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 PrknQ9WVS6 464 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Plxnb1Q8CJH3 2119 aa10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Arid1aA2BH40 2283 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vmn1r77E9PY60 306 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc10a1O08705 362 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 IlkO55222 452 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nsg2P47759 171 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cdh26P59862 763 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 AhrrQ3U1U7 701 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 VwceQ3U515 929 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf488Q5HZG9 337 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 LcorQ6ZPI3 433 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Acot4Q8BWN8 421 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gucd1Q8BZI6 239 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rcbtb2Q99LJ7 551 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 IqchQ9D2K4 1071 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cers4Q9D6J1 393 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Elovl4Q9EQC4 312 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pdcd1lg2Q9WUL5 247 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pmm2Q9Z2M7 242 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Loxhd1C8YR32 2068 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm14085A2AWR5 660 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Olfr31E9Q3K2 317 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prdx4O08807 274 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mmp2P33434 662 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sox14Q04892 240 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccdc69Q3TCJ8 202 aa10.88□□□□□ -0.67
Herc3-201ENSMUST00000031823 Khdc4Q3TCX3 612 aa10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.4 ms