RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 A0A1B0GTL3 188 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 E7ENX8 843 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CYR61O00622 381 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PIP5K1BO14986 540 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 STX7O15400 261 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 OR1I1O60431 355 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 NRP2O60462 931 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 VPS26AO75436 327 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ATP6AP2O75787 350 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 NDUFS1P28331 727 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 GCH1P30793 250 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CA5AP35218 305 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PRKAG1P54619 331 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CDNFQ49AH0 187 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CATSPEREQ5SY80 951 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 FAM111BQ6SJ93 734 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 DCAF4L2Q8NA75 395 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PIH1D2Q8WWB5 315 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 MR1Q95460 341 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ROPN1LQ96C74 230 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PANX1Q96RD7 426 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 REEP4Q9H6H4 257 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 NANSQ9NR45 359 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SEC14L4Q9UDX3 406 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CD84Q9UIB8 345 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 KLHL21Q9UJP4 597 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 INSL5Q9Y5Q6 135 aa7.13□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 TUBAL3A6NHL2 446 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CBY3A6NI87 242 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 BBIP1A8MTZ0 92 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 K7EP13 123 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ADAP1O75689 374 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CYP7B1O75881 506 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 MATN4O95460 622 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ESR1P03372 595 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CD6P30203 668 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 RAP1AP62834 184 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 GAB4Q2WGN9 574 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 OR8J3Q8NGG0 315 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 OR2D3Q8NGH3 330 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 WFDC5Q8TCV5 224 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 KAT2AQ92830 837 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 TM4SF18Q96CE8 201 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 TMEM169Q96HH4 297 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 LRR1Q96L50 414 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 JAM3Q9BX67 310 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SPAG4Q9NPE6 437 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SLC52A3Q9NQ40 469 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SMPD4Q9NXE4 827 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 TBX21Q9UL17 535 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 A0A0A6YYH2 397 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PRORSD1PA6NEY8 169 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 A6NJ64 397 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 FAM170BA6NMN3 283 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PRRG1O14668 218 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SOX15O60248 233 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CPNE6O95741 557 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 C6orf47O95873 294 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 IL2P60568 153 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 RHOAP61586 193 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 PKIAP61925 76 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CACNG1Q06432 222 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 SLAMF1Q13291 335 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 GTF2H3Q13889 308 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 TRIM60Q495X7 471 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 MTX3Q5HYI7 312 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 NCMAPQ5T1S8 102 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 LILRA2Q8N149 483 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 RNF148Q8N7C7 305 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 YIPF7Q8N8F6 280 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CYB561A3Q8NBI2 242 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 CAMKVQ8NCB2 501 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 OR9I1Q8NGQ6 314 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 STK35Q8TDR2 534 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 AUTS2Q8WXX7 1259 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 TAAR6Q96RI8 345 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 HINT2Q9BX68 163 aa7.12□□□□□ -1.27
HCG18-244ENST00000602516 ING2Q9H160 280 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms