RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584538.1

USP22-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 22, human

TSL 4

Gene USP22, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP22-211	ENST00000584538	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	10.75	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		10.75	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	NANOG	Q9H9S0	305 aa		10.75	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	DNAJB12	Q9NXW2	375 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	FLNC	Q14315	2725 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	ZNF264	O43296	627 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	HCRTR2	O43614	444 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	GMFG	O60234	142 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	EIF4E2	O60573	245 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	SEMA7A	O75326	666 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	TRAPPC6A	O75865	159 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	NTN1	O95631	604 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	EPPIN	O95925	133 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	NPPA	P01160	153 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	LINGO3	P0C6S8	592 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	NID1	P14543	1247 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	HPGD	P15428	266 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	ABO	P16442	354 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	ZNF17	P17021	662 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	BMP7	P18075	431 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	HK1	P19367	917 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	MSX1	P28360	303 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	LHX2	P50458	406 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	P2RX1	P51575	399 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	CRYBA2	P53672	197 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	DLX5	P56178	289 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	RBPJ	Q06330	500 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	FOXF1	Q12946	379 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	ELOA	Q14241	798 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	C4orf17	Q53FE4	359 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	RNF220	Q5VTB9	566 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	VASN	Q6EMK4	673 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	SERPINA11	Q86U17	422 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	COMTD1	Q86VU5	262 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	VRK2	Q86Y07	508 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	RPRML	Q8N4K4	120 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	METTL25	Q8N6Q8	603 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	WDR60	Q8WVS4	1066 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	PMM1	Q92871	262 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	RELT	Q969Z4	430 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	LAT2	Q9GZY6	243 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	HHATL	Q9HCP6	504 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	EXOSC3	Q9NQT5	275 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	MED17	Q9NVC6	651 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	CALML5	Q9NZT1	146 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	USP22	Q9UPT9	525 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	CARD8	Q9Y2G2	431 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	GPC6	Q9Y625	555 aa	Predicted RBP	10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	10.74	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	C15orf38-AP3S2	A0A0A6YYH1	394 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538		A0A0G2JPF8	293 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	OR2M5	A3KFT3	312 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	EVPLL	A8MZ36	301 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	KDM4E	B2RXH2	506 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	HNRNPCL3	B7ZW38	293 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	NPIPA2	E9PIF3	369 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538		H3BNH8	94 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	BCKDK	O14874	412 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	HNRNPCL1	O60812	293 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	DCTN3	O75935	186 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	PGM3	O95394	542 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	CSTA	P01040	98 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	TPO	P07202	933 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	THBS1	P07996	1170 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	HNRNPCL4	P0DMR1	293 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	ZNF708	P17019	499 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	PCGF2	P35227	344 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	CLDN18	P56856	261 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	CDK6	Q00534	326 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	RBBP4	Q09028	425 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	SCARB2	Q14108	478 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	MMEL1	Q495T6	779 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	SLC25A53	Q5H9E4	307 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	MRPL2	Q5T653	305 aa	Known RBP	10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	RTL6	Q6ICC9	239 aa		10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	10.73	□□□□□ -0.69
USP22-211	ENST00000584538	IFNE	Q86WN2	208 aa		10.73	□□□□□ -0.69

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