RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517504.5

TNIP1-204, Transcript of TNFAIP3 interacting protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene TNIP1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIP1-204ENST00000517504 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.61□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.61□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 TNFSF13O75888 250 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 RCBTB2O95199 551 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 TGM6O95932 706 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 PLATP00750 562 aa6.6□□□□□ -1.35
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TNIP1-204ENST00000517504 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 HK1P19367 917 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 GABRA3P34903 492 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 GPC1P35052 558 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 OPRM1P35372 400 aa6.6□□□□□ -1.35
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TNIP1-204ENST00000517504 SORDQ00796 357 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 ZNF844Q08AG5 666 aa6.6□□□□□ -1.35
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TNIP1-204ENST00000517504 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
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TNIP1-204ENST00000517504 RAET1LQ5VY80 246 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 MFSD12Q6NUT3 480 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 PGM2L1Q6PCE3 622 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 SPNS3Q6ZMD2 512 aa6.6□□□□□ -1.35
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TNIP1-204ENST00000517504 SZRD1Q7Z422 152 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 ZAR1Q86SH2 424 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 GALNT10Q86SR1 603 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 MARCH3Q86UD3 253 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 TREML1Q86YW5 311 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 SLC16A11Q8NCK7 471 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 OR7A2PQ8NGA2 310 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 OR5M1Q8NGP8 315 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 FAM222BQ8WU58 562 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 NUDT8Q8WV74 236 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 MTERF3Q96E29 417 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 DTNBP1Q96EV8 351 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 MS4A3Q96HJ5 214 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 COG8Q96MW5 612 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.6□□□□□ -1.35
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TNIP1-204ENST00000517504 TMEM109Q9BVC6 243 aa6.6□□□□□ -1.35
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TNIP1-204ENST00000517504 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 GALNT8Q9NY28 637 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 MED11Q9P086 117 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 SH3BP4Q9P0V3 963 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 ATP6V1HQ9UI12 483 aa6.6□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.6□□□□□ -1.35
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TNIP1-204ENST00000517504 VPS13CQ709C8 3753 aa6.59□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 A0A1W2PNV4 684 aa6.59□□□□□ -1.35
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TNIP1-204ENST00000517504 A6NNC1 897 aa6.59□□□□□ -1.35
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TNIP1-204ENST00000517504 DOK2O60496 412 aa6.59□□□□□ -1.35
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TNIP1-204ENST00000517504 KCNH1O95259 989 aa6.59□□□□□ -1.35
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TNIP1-204ENST00000517504 LAMP1P11279 417 aa6.59□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
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TNIP1-204ENST00000517504 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 BCL2A1Q16548 175 aa6.59□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.59□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 KRT71Q3SY84 523 aa6.59□□□□□ -1.35
TNIP1-204ENST00000517504 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.59□□□□□ -1.35
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