RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514275.5

IFT122-231, Transcript of intraflagellar transport 122, human

TSL 5

Gene IFT122, Length 296 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFT122-231	ENST00000514275	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	WDR45	Q9Y484	360 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	KIF26A	Q9ULI4	1882 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	PLXND1	Q9Y4D7	1925 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275		A0A1W2PQ09	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	TRAPPC13	A5PLN9	417 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	HTR3E	A5X5Y0	456 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	URAD	A6NGE7	173 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	CDC42EP2	O14613	210 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	STX11	O75558	287 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	SOX30	O94993	753 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	NKX2-2	O95096	273 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	RCBTB2	O95199	551 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	APOL3	O95236	402 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	SLC2A10	O95528	541 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	CH25H	O95992	272 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	ATP1B1	P05026	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	CSF3	P09919	207 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	TRAPPC2	P0DI81	140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	TRAPPC2B	P0DI82	140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	EDN3	P14138	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	NID1	P14543	1247 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	HOXB2	P14652	356 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	MAK	P20794	623 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	S1PR1	P21453	382 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	TBXA2R	P21731	343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.62	□□□□□ -1.67	3e-10	■■■■■ 48.8
IFT122-231	ENST00000514275	HTR2A	P28223	471 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	GABRA5	P31644	462 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	ACTR1B	P42025	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	GPR4	P46093	362 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	CDH11	P55287	796 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	CTBP2	P56545	445 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	FXYD6P3	P58550	94 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	ACTR1A	P61163	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	UBE2I	P63279	158 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	MRPS21	P82921	87 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	MXD1	Q05195	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	SCN1B	Q07699	218 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	RIN1	Q13671	783 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	ALG11	Q2TAA5	492 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	DEFB134	Q4QY38	66 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	EIPR1	Q53HC9	387 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	ZMAT1	Q5H9K5	638 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	EOGT	Q5NDL2	527 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	CCNJ	Q5T5M9	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	VASN	Q6EMK4	673 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF544	Q6NX49	715 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	SLC30A6	Q6NXT4	461 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	SHF	Q7M4L6	423 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	RAB43	Q86YS6	212 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	CPO	Q8IVL8	374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	CA13	Q8N1Q1	262 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	LNX2	Q8N448	690 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	ARHGEF39	Q8N4T4	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	SCAI	Q8N9R8	606 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	OR2T33	Q8NG76	320 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	DOK4	Q8TEW6	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	TMEM239	Q8WW34	195 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	SPRYD4	Q8WW59	207 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	SLC35B4	Q969S0	331 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	CTHRC1	Q96CG8	243 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	TMCO6	Q96DC7	493 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	MRPL38	Q96DV4	380 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	ZNF486	Q96H40	463 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	ABHD8	Q96I13	439 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	SPACA7	Q96KW9	195 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	MRGPRX1	Q96LB2	322 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	STAC	Q99469	402 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	TM9SF2	Q99805	663 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	ATF6B	Q99941	703 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IFT122-231	ENST00000514275	GDF15	Q99988	308 aa		4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms