RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 PERPQ96FX8 193 aa10.67□□□□□ -0.7
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RABGEF1-207ENST00000484547 SLC29A1Q99808 456 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 UBTD1Q9HAC8 227 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 CXorf21Q9HAI6 301 aa10.67□□□□□ -0.7
RABGEF1-207ENST00000484547 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
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RABGEF1-207ENST00000484547 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP10.65□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 STARP49675 285 aa10.65□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 GABARAPL2P60520 117 aa10.65□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM27E3Q08E93 113 aa10.65□□□□□ -0.71
RABGEF1-207ENST00000484547 FUT7Q11130 342 aa10.65□□□□□ -0.71
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