RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481115.2

PKP4-211, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 884 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-211ENST00000481115 HAPLN1P10915 354 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 RAB6AP20340 208 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 S1PR1P21453 382 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 FPR3P25089 353 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 EPHA2P29317 976 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MPGP29372 298 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CRABP1P29762 137 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CCR7P32248 378 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 NNMTP40261 264 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 LIMS1P48059 325 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 LHX1P48742 406 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 EPHB3P54753 998 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 FOXA1P55317 472 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CTBP2P56545 445 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 HSD17B7P56937 341 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PKIAP61925 76 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SLC7A9P82251 487 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 VLDLRP98155 873 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 BEX3Q00994 111 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SP4Q02446 784 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CNTN1Q12860 1018 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 GAS6Q14393 721 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 P2RY14Q15391 338 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 KCNA10Q16322 511 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ST3GAL2Q16842 350 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SLC36A2Q495M3 483 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 AFMIDQ63HM1 303 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 C12orf73Q69YU5 71 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MRNIPQ6NTE8 343 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 NCEH1Q6PIU2 408 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CD300LDQ6UXZ3 194 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 DEF8Q6ZN54 512 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 LAS2Q8IYD9 372 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CARFQ8N187 725 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 RASGEF1AQ8N9B8 481 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 BPIFCQ8NFQ6 507 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 DBF4BQ8NFT6 615 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OR5J2Q8NH18 312 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OR52P1PQ8NH57 321 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 AKR7LQ8NHP1 331 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SLC7A13Q8TCU3 470 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 LCN9Q8WX39 176 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 EDAQ92838 391 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 R3HDM4Q96D70 268 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OR52E6Q96RD3 313 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MRI1Q9BV20 369 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 DUSP26Q9BV47 211 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TMED9Q9BVK6 235 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ABCG8Q9H221 673 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OR51V1Q9H2C8 321 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 REEP4Q9H6H4 257 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 NUDT4Q9NZJ9 180 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PIPOXQ9P0Z9 390 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TSPAN16Q9UKR8 245 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.69□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OR14I1A6ND48 311 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ACOD1A6NK06 481 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OR6C75A6NL08 312 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TMEM210A6NLX4 147 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 WASH3PC4AMC7 463 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 TSTD3H0UI37 97 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 H7C1Q1 480 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 AP4M1O00189 453 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 LGALS8O00214 317 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 LRRTM2O43300 516 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 FGF16O43320 207 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OR2F2O95006 317 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 OAZ2O95190 189 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PAPLNO95428 1278 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ZNF682O95780 498 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 ZNF286BP0CG31 522 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 NID1P14543 1247 aa6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PKP4-211ENST00000481115 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms