RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437078.6

RABGEF1-210, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RABGEF1, Length 4,319 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-210ENST00000437078 GINS4Q9BRT9 223 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM60AQ9NP50 221 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 INIPQ9NRY2 104 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 ASB4Q9Y574 426 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa12.65□□□□□ -0.38
RABGEF1-210ENST00000437078 FABP12A6NFH5 140 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 TTLL8A6PVC2 850 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 OAFQ86UD1 273 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 C19orf18Q8NEA5 215 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 GAL3ST3Q96A11 431 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 MED30Q96HR3 178 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 DGAT2Q96PD7 388 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 AICDAQ9GZX7 198 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 FN3KQ9H479 309 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 BEX1Q9HBH7 125 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 CEP250Q9BV73 2442 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 MPZL2O60487 215 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 GABARAPO95166 117 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ETV5P41161 510 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ETV1P50549 477 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 GFERP55789 205 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 LPAL2Q16609 132 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM174AQ8TBP5 190 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 RIT1Q92963 219 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ZFP3Q96NJ6 502 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 MND1Q9BWT6 205 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 TRAV20A0A0B4J274 112 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ISPDA4D126 451 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 SAGE2PA6NJ88 616 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 C11orf98E9PRG8 122 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 CLDN4O14493 209 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 HRO43593 1189 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 PLOD3O60568 738 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 RAD1O60671 282 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 CD79BP40259 229 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 DCST2Q5T1A1 773 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 HSPA12BQ96MM6 686 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 NELL2Q99435 816 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 TTC28Q96AY4 2481 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 CACNA1GO43497 2377 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 CASC3O15234 703 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 CSO75390 466 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 GPX5O75715 221 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 RPS25P62851 125 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 LAX1Q8IWV1 398 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 SLC44A3Q8N4M1 653 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 TMEM52Q8NDY8 209 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 SDR9C7Q8NEX9 313 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 OR5H6Q8NGV6 325 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 UFD1Q92890 307 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 CALML5Q9NZT1 146 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 CLEC1BQ9P126 229 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 BOLA1Q9Y3E2 137 aa12.64□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 FAM86C2PA6NEL3 165 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 OR6C70A6NIJ9 312 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 C5orf67F2Z3F1 127 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 HRKO00198 91 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 STX11O75558 287 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 RAB36O95755 333 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 PLGP00747 810 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 CLUP10909 449 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 DSG2Q14126 1118 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ARL14Q8N4G2 192 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 SCPEP1Q9HB40 452 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 A4GALTQ9NPC4 353 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 NECTIN3Q9NQS3 549 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 A4GNTQ9UNA3 340 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 C2orf72A6NCS6 295 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 SCO1O75880 301 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 LSSP48449 732 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 MAPK14Q16539 360 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ZMAT1Q5H9K5 638 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 GPR135Q8IZ08 494 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ZNF671Q8TAW3 534 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 PRRC1Q96M27 445 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 MS4A4EQ96PG1 132 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 IKZF2Q9UKS7 526 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 RIIAD1A6NNX1 92 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 SEMA7AO75326 666 aa12.63□□□□□ -0.39
RABGEF1-210ENST00000437078 CD40LGP29965 261 aa12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.8 ms