RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390930.1

SNORD17-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 17, humanhuman

BASIC

Gene SNORD17, Length 237 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD17-201ENST00000390930 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
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SNORD17-201ENST00000390930 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa3.12□□□□□ -1.91
SNORD17-201ENST00000390930 A0A0J9YW62 118 aa3.12□□□□□ -1.91
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