RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000627440.2

SNAP23-223, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-223	ENST00000627440	NUP54	Q7Z3B4	507 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	OR9A1P	Q8NGU1	263 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	OR5R1	Q8NH85	324 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	OR2V1	Q8NHB1	315 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	SPATA22	Q8NHS9	363 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	5.12	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	RAPGEF5	Q92565	580 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	HGD	Q93099	445 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	PHF21B	Q96EK2	531 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	MUS81	Q96NY9	551 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	FERMT1	Q9BQL6	677 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	CMAHP	Q9Y471	501 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV2-70D	A0A0C4DH43	119 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	OR6C65	A6NJZ3	312 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440		H3BQV1	296 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	KCNK1	O00180	336 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	TNFSF11	O14788	317 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	MFSD11	O43934	449 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	LDB3	O75112	727 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	PRKD3	O94806	890 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	AIFM1	O95831	613 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	GRK2	P25098	689 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	EDNRA	P25101	427 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	MC4R	P32245	332 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	CRYBB2	P43320	205 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	FNTA	P49354	379 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	EVX1	P49640	407 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	PRPS1	P60891	318 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	FGF12	P61328	243 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	HERVK_113	P63132	956 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ERVK-8	P63133	956 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	NAAA	Q02083	359 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ID2	Q02363	134 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	TRAF3	Q13114	568 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	EFTUD2	Q15029	972 aa	Known RBP eCLIP	5.11	□□□□□ -1.59	3e-8	■■■■□ 19.4
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF239	Q16600	458 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	HBM	Q6B0K9	141 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	CNTD1	Q8N815	330 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	CCDC126	Q96EE4	140 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	MCEE	Q96PE7	176 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	PEBP4	Q96S96	227 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	VPS11	Q9H270	941 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ERVK-19	Q9WJR5	959 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	B3GALT2	O43825	422 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	IGHV3-9	P01782	118 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	SHC1	P29353	583 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	CALCR	P30988	508 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	HSD17B2	P37059	387 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	MAGEB1	P43366	347 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ZBTB17	Q13105	803 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	RCN2	Q14257	317 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	CYP27C1	Q4G0S4	372 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	C1QTNF12	Q5T7M4	302 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ETV3L	Q6ZN32	361 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	PSTK	Q8IV42	348 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	KLHL36	Q8N4N3	616 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	SPIC	Q8N5J4	248 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	GPATCH11	Q8N954	259 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	NT5C	Q8TCD5	201 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	TSGA13	Q96PP4	275 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	ZNF649	Q9BS31	505 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	CEP41	Q9BYV8	373 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	CLIC4	Q9Y696	253 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SNAP23-223	ENST00000627440	CENPVL1	A0A0U1RR11	272 aa		5.09	□□□□□ -1.59

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