RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589825.5

EFTUD2-215, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-215ENST00000589825 GPATCH2Q9NW75 528 aa14.54□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 CLCF1Q9UBD9 225 aa14.54□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 AP4B1Q9Y6B7 739 aa14.54□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa14.54□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 PCNX3Q9H6A9 2034 aa14.54□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 ABCA12Q86UK0 2595 aa14.54□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 UQCRHLA0A096LP55 91 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 E9PBE3 544 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 HCRTR2O43614 444 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 AGR2O95994 175 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 AK1P00568 194 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF17P17021 662 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 UQCRC2P22695 453 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 ME2P23368 584 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 DLX5P56178 289 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 ATAD3BQ5T9A4 648 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 OGFOD2Q6N063 350 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 ANKRD46Q86W74 232 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 GCNT2Q8N0V5 402 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 OR5D16Q8NGK9 328 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 ACTRT2Q8TDY3 377 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 ZBTB8AQ96BR9 441 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 PINK1Q9BXM7 581 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 PIGMQ9H3S5 423 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.53□□□□□ -0.08
EFTUD2-215ENST00000589825 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 GOLGA8OA6NCC3 632 aa14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 GOLGA8NF8WBI6 632 aa14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 SDHDO14521 159 aa14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 SNNO75324 88 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 TNFRSF21O75509 655 aa14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 EPHA3P29320 983 aa14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 ATP12AP54707 1039 aa14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 NME5P56597 212 aa14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 FOXF2Q12947 444 aa14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 POMZP3Q6PJE2 187 aa14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 PLXDC2Q6UX71 529 aa14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 C16orf62Q7Z3J2 963 aa14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 LUZP2Q86TE4 346 aa14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 ZZZ3Q8IYH5 903 aa14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 TRIML2Q8N7C3 387 aa14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 SH3GL2Q99962 352 aa14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 KCNE3Q9Y6H6 103 aa14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa14.52□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 APCP25054 2843 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 TUBAL3A6NHL2 446 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 SHISA8B8ZZ34 492 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 NPIPA7E9PJI5 369 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 STX11O75558 287 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 TGM6O95932 706 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 CRHP06850 196 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 NPIPA8P0DM63 369 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 FCGR2AP12318 317 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 EIF1P41567 113 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 CLDN15P56746 228 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 CLDN20P56880 219 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 RPS26P62854 115 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 LRRC74AQ0VAA2 488 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 GPR68Q15743 365 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 CD226Q15762 336 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 PDSS1Q5T2R2 415 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 FBXW10Q5XX13 1052 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 CLEC4FQ8N1N0 589 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 SDF2Q99470 211 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 MED17Q9NVC6 651 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 AIG1Q9NVV5 245 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 PACSIN3Q9UKS6 424 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 ZNF175Q9Y473 711 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 DTNAQ9Y4J8 743 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 MED12LQ86YW9 2145 aa14.51□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 H0YC42 278 aa14.5□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 ANKRD28O15084 1053 aa14.5□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP14.5□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 IDO1P14902 403 aa14.5□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 P2RX1P51575 399 aa14.5□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
EFTUD2-215ENST00000589825 UFM1P61960 85 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms