RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ACER3Q9NUN7 267 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 KCNN3Q9UGI6 736 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 C2orf74A8MZ97 194 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 FGF18O76093 207 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 SPARCP09486 303 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 CR2P20023 1033 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 NPR2P20594 1047 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 HTR1FP30939 366 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 MC3RP41968 323 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 MASP1P48740 699 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 CTSCP53634 463 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 RPS21P63220 83 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 UBE2NLQ5JXB2 153 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 SFXN4Q6P4A7 337 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 RNF175Q8N4F7 328 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 TM9SF4Q92544 642 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 BPIFA2Q96DR5 249 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 DPYSL5Q9BPU6 564 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ABCG4Q9H172 646 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 IKZF5Q9H5V7 419 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 EDARQ9UNE0 448 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF726A6NNF4 738 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 SPDEFO95238 335 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 RAB3DO95716 219 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 LALBAP00709 142 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 MT-ND4P03905 459 aa9.75□□□□□ -0.85
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PTPRM-205ENST00000577827 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 LYPD4Q6UWN0 246 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 BEST4Q8NFU0 473 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 OR5M3Q8NGP4 307 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 OR5AR1Q8NGP9 310 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 DTD2Q96FN9 168 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
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PTPRM-205ENST00000577827 EPHA6Q9UF33 1036 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 CAMK2AQ9UQM7 478 aa9.75□□□□□ -0.85
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PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PPL8 197 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 F8W036 122 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRM-205ENST00000577827 CYBAP13498 195 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRM-205ENST00000577827 AHRP35869 848 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 CAV3P56539 151 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRM-205ENST00000577827 BLOC1S1P78537 153 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 DSC1Q08554 894 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ENTPD8Q5MY95 495 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRM-205ENST00000577827 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 C7orf34Q96L11 122 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 CLCC1Q96S66 551 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 CDC6Q99741 560 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 RGCCQ9H4X1 137 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 GALNT9Q9HCQ5 603 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRM-205ENST00000577827 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRM-205ENST00000577827 PRPH2P23942 346 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRM-205ENST00000577827 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRM-205ENST00000577827 FOXRED2Q8IWF2 684 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ACOT4Q8N9L9 421 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 CYB561A3Q8NBI2 242 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 TRIB2Q92519 343 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
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PTPRM-205ENST00000577827 GSX2Q9BZM3 304 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 ZNF700Q9H0M5 742 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRM-205ENST00000577827 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
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