RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568477.5

CMTM3-215, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CMTM3, Length 687 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-215ENST00000568477 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 RAP2CQ9Y3L5 183 aa13.04□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF337Q9Y3M9 751 aa13.04□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 MED12LQ86YW9 2145 aa13.04□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 TUBAL3A6NHL2 446 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 H3BML4 177 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 SCDO00767 359 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 CFLARO15519 480 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 SEC14L5O43304 696 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 CTAG2O75638 210 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 TGM6O95932 706 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 CRHP06850 196 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 CPA2P48052 419 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 C21orf58P58505 322 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 CCNJQ5T5M9 372 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 OR2A2Q6IF42 318 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 CDC73Q6P1J9 531 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 ZAR1Q86SH2 424 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 MISPQ8IVT2 679 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 KIRREL3Q8IZU9 778 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 GATSQ8NAP1 163 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 CCDC197Q8NCU1 140 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 PSMA8Q8TAA3 256 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 SFXN5Q8TD22 340 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 SMPDL3BQ92485 455 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 CDS1Q92903 461 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 MOAP1Q96BY2 351 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 DUSP26Q9BV47 211 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 ACTRT3Q9BYD9 372 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 PIGUQ9H490 435 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 CXorf36Q9H7Y0 433 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 MANSC1Q9H8J5 431 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 PACSIN3Q9UKS6 424 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 MPDZO75970 2070 aa13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
CMTM3-215ENST00000568477 A0A087WZY1 265 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 A0A1W2PNV4 684 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 A6NNC1 897 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 SNX3O60493 162 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 EDF1O60869 148 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 TNFRSF21O75509 655 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 SOX30O94993 753 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 ATP6V1C1P21283 382 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 BGNP21810 368 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 SOAT1P35610 550 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 SLC1A6P48664 564 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 CLDN15P56746 228 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 CLDN8P56748 225 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 TMEM44Q2T9K0 475 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 PGS1Q32NB8 556 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 CAMKMTQ7Z624 323 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 LUZP2Q86TE4 346 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 ANKS4BQ8N8V4 417 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 ADAMTS15Q8TE58 950 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 NUDT8Q8WV74 236 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 PPP1R36Q96LQ0 422 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 PINK1Q9BXM7 581 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 FBXO34Q9NWN3 711 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 GIN1Q9NXP7 522 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 STOML1Q9UBI4 398 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 VDAC3Q9Y277 283 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF175Q9Y473 711 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 AP4B1Q9Y6B7 739 aa13.02□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 PCNX3Q9H6A9 2034 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 AKAP9Q99996 3911 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 HIVEP1P15822 2718 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 A0A1W2PQD3 144 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 SHISA8B8ZZ34 492 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 H0YC42 278 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 TNFSF13O75888 250 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF17P17021 662 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 RPL14P50914 215 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 CLDN20P56880 219 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 STX3Q13277 289 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 ATG16L1Q676U5 607 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 BHLHB9Q6PI77 547 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 FIG4Q92562 907 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 SORT1Q99523 831 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 C20orf27Q9GZN8 174 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 AKTIPQ9H8T0 292 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 RASSF1Q9NS23 344 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 GPATCH2Q9NW75 528 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 GALNT8Q9NY28 637 aa13.01□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 FAM221AA4D161 298 aa13□□□□□ -0.33
CMTM3-215ENST00000568477 C7orf72A4D263 438 aa13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.7 ms