RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558131.1

RPL28-205, Transcript of ribosomal protein L28, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene RPL28, Length 444 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL28-205ENST00000558131 PRKAG1P54619 331 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 ZNF844Q08AG5 666 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 MLC1Q15049 377 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 VPS26BQ4G0F5 336 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 C20orf204Q6ZNR8 217 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 ZFP28Q8NHY6 868 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 KIF18AQ8NI77 898 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 ACTRT2Q8TDY3 377 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 NUDT8Q8WV74 236 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 ZBTB8AQ96BR9 441 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 ZNF524Q96C55 264 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 Q96MF0 132 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 TMEM185BQ9H7F4 350 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 MKS1Q9NXB0 559 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 FIS1Q9Y3D6 152 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 ARID1AO14497 2285 aa14.61□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 SMIM23A6NLE4 172 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 H7C1Q1 480 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 COPEO14579 308 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 TNFSF11O14788 317 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 EFNA2O43921 213 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 PLAUP00749 431 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 BCKDHAP12694 445 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 FPR1P21462 350 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 MANFP55145 182 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 RAC1P63000 192 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 ZNF117Q03924 483 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 SGCBQ16585 318 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 XKR7Q5GH72 579 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 OR6Y1Q8NGX8 325 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 OR2V1Q8NHB1 315 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 CEP70Q8NHQ1 597 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 TWIST2Q8WVJ9 160 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 MTERF3Q96E29 417 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 PERPQ96FX8 193 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 TMEM204Q9BSN7 226 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 GSX2Q9BZM3 304 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 KLHL4Q9C0H6 718 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 SH3BP4Q9P0V3 963 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 ATP6V1HQ9UI12 483 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 TMED5Q9Y3A6 229 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 FREM1Q5H8C1 2179 aa14.6□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 TRIM64A6NGJ6 449 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 TRIM64BA6NI03 449 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 PIP5K1BO14986 540 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 ARHGEF9O43307 516 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 FGF4P08620 206 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 PAX1P15863 534 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 LCN1P31025 176 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 FOXF1Q12946 379 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 GALNTL6Q49A17 601 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 CPTPQ5TA50 214 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 CBLN3Q6UW01 205 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 SZRD1Q7Z422 152 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 P3H2Q8IVL5 708 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 CCDC63Q8NA47 563 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 RNF128Q8TEB7 428 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 CDS1Q92903 461 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 TRMOQ9BU70 441 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 MECRQ9BV79 373 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 SRXN1Q9BYN0 137 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 PPCSQ9HAB8 311 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 UBQLN4Q9NRR5 601 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 DUSP22Q9NRW4 184 aa14.59□□□□□ -0.07
RPL28-205ENST00000558131 TRIM13O60858 407 aa14.58□□□□□ -0.08
RPL28-205ENST00000558131 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RPL28-205ENST00000558131 ALOX5P09917 674 aa14.58□□□□□ -0.08
RPL28-205ENST00000558131 ALDH3A1P30838 453 aa14.58□□□□□ -0.08
RPL28-205ENST00000558131 PTH2RP49190 550 aa14.58□□□□□ -0.08
RPL28-205ENST00000558131 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RPL28-205ENST00000558131 PTGR1Q14914 329 aa14.58□□□□□ -0.08
RPL28-205ENST00000558131 BEX5Q5H9J7 111 aa14.58□□□□□ -0.08
RPL28-205ENST00000558131 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.58□□□□□ -0.08
RPL28-205ENST00000558131 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
RPL28-205ENST00000558131 TRABD2AQ86V40 505 aa14.58□□□□□ -0.08
RPL28-205ENST00000558131 MISPQ8IVT2 679 aa14.58□□□□□ -0.08
RPL28-205ENST00000558131 COX18Q8N8Q8 333 aa14.58□□□□□ -0.08
RPL28-205ENST00000558131 BANPQ8N9N5 519 aa14.58□□□□□ -0.08
RPL28-205ENST00000558131 OR7A2PQ8NGA2 310 aa14.58□□□□□ -0.08
RPL28-205ENST00000558131 APOPT1Q96IL0 206 aa14.58□□□□□ -0.08
RPL28-205ENST00000558131 C3orf30Q96M34 536 aa14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms