RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 COX18Q8N8Q8 333 aa15.15■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 ACTRT2Q8TDY3 377 aa15.15■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 ZBTB8AQ96BR9 441 aa15.15■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 PERPQ96FX8 193 aa15.15■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 KLHDC3Q9BQ90 382 aa15.15■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 PPCSQ9HAB8 311 aa15.15■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 UBQLN4Q9NRR5 601 aa15.15■□□□□ 0.02
HERC3-211ENST00000513325 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
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HERC3-211ENST00000513325 TMEM233B4DJY2 109 aa15.14■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 H7C1Q1 480 aa15.14■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 TNFSF11O14788 317 aa15.14■□□□□ 0.01
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HERC3-211ENST00000513325 ADAMDEC1O15204 470 aa15.14■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 TRIM13O60858 407 aa15.14■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 SYNGR4O95473 234 aa15.14■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 LY6G6DO95868 133 aa15.14■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 CHEK2O96017 543 aa15.14■□□□□ 0.01
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HERC3-211ENST00000513325 HPGDP15428 266 aa15.14■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 IL11P20809 199 aa15.14■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 ASMTP46597 345 aa15.14■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 SERPINB4P48594 390 aa15.14■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
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HERC3-211ENST00000513325 STAC2Q6ZMT1 411 aa15.14■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa15.14■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
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HERC3-211ENST00000513325 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa15.14■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 POC1BQ8TC44 478 aa15.14■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 JADE3Q92613 823 aa15.14■□□□□ 0.01
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HERC3-211ENST00000513325 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 COX4I2Q96KJ9 171 aa15.14■□□□□ 0.01
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HERC3-211ENST00000513325 MID2Q9UJV3 735 aa15.14■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 TMED5Q9Y3A6 229 aa15.14■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 FAM171A2A8MVW0 826 aa15.13■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 SCDO00767 359 aa15.13■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 KLF4O43474 513 aa15.13■□□□□ 0.01
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HERC3-211ENST00000513325 PPP3CBP16298 524 aa15.13■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 LCN1P31025 176 aa15.13■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 PRIM2P49643 509 aa15.13■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 CD226Q15762 336 aa15.13■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 BEX5Q5H9J7 111 aa15.13■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 HBMQ6B0K9 141 aa15.13■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
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HERC3-211ENST00000513325 CHMP6Q96FZ7 201 aa15.13■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 BTBD2Q9BX70 525 aa15.13■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 A0A1W2PQD3 144 aa15.12■□□□□ 0.01
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HERC3-211ENST00000513325 TRIM64BA6NI03 449 aa15.12■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 FGF4P08620 206 aa15.12■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 ME2P23368 584 aa15.12■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 MLC1Q15049 377 aa15.12■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 UGT3A2Q3SY77 523 aa15.12■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 PDSS1Q5T2R2 415 aa15.12■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa15.12■□□□□ 0.01
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HERC3-211ENST00000513325 OR7A2PQ8NGA2 310 aa15.12■□□□□ 0.01
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HERC3-211ENST00000513325 CDS1Q92903 461 aa15.12■□□□□ 0.01
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HERC3-211ENST00000513325 C12orf49Q9H741 205 aa15.12■□□□□ 0.01
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HERC3-211ENST00000513325 GIMAP2Q9UG22 337 aa15.12■□□□□ 0.01
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HERC3-211ENST00000513325 TRAF6Q9Y4K3 522 aa15.12■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 SNX8Q9Y5X2 465 aa15.12■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 ARID1AO14497 2285 aa15.12■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 PIP5K1BO14986 540 aa15.11■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 PLAUP00749 431 aa15.11■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 LINGO3P0C6S8 592 aa15.11■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 SHC1P29353 583 aa15.11■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 AGTR1P30556 359 aa15.11■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 ALDH3A1P30838 453 aa15.11■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 SFTPDP35247 375 aa15.11■□□□□ 0.01
HERC3-211ENST00000513325 HPCAL1P37235 193 aa15.11■□□□□ 0.01
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