RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 CPN1P15169 458 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF24P17028 368 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF3P17036 446 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 PGCP20142 388 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 EDNRAP25101 427 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 GIFP27352 417 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 LONP1P36776 959 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 OR3A2P47893 321 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 SRYQ05066 204 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 TRAF3Q13114 568 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 SNTA1Q13424 505 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 KRT81Q14533 505 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF699Q32M78 642 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 BCL7AQ4VC05 210 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 STXBP5Q5T5C0 1151 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 TRIM65Q6PJ69 517 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 Q6ZRG5 221 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 COLCA1Q6ZS62 124 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 Q6ZVQ6 151 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 SSX9Q7RTT3 188 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 BHLHA9Q7RTU4 235 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 PIGZQ86VD9 579 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 WDR49Q8IV35 697 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 SLC22A15Q8IZD6 547 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 PYROXD2Q8N2H3 581 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 KLHDC1Q8N7A1 406 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 NANOGP1Q8N7R0 232 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 C15orf54Q8N8G6 183 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 BEST4Q8NFU0 473 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 FBXO25Q8TCJ0 367 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 GATAD1Q8WUU5 269 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 PEX13Q92968 403 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 ZG16BQ96DA0 208 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 IGSF21Q96ID5 467 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 CATSPER2Q96P56 530 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 CHRDL1Q9BU40 450 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 FAM192AQ9GZU8 254 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 MED20Q9H944 212 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 UCK1Q9HA47 277 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 ELOVL3Q9HB03 270 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 LRRC4Q9HBW1 653 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 GPR83Q9NYM4 423 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 SEC14L3Q9UDX4 400 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 RASD1Q9Y272 281 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 SLC6A5Q9Y345 797 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 PPIAL4AQ9Y536 164 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF236Q9UL36 1845 aa1.96□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 COL4A5P29400 1685 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 A0A0A6YYD4 124 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 ASB14A6NK59 587 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 NVLO15381 856 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 CIDEAO60543 219 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 KRT36O76013 467 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 OAZ2O95190 189 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 ALPIP09923 528 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 POU2F1P14859 743 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 C4BPBP20851 252 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 MSNP26038 577 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 GJB2P29033 226 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 RPL9P32969 192 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 DLSTP36957 453 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 SYKP43405 635 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 RAB9AP51151 201 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 PLA2G16P53816 162 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 DR1Q01658 176 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 PJVKQ0ZLH3 352 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 HADHQ16836 314 aaKnown RBP1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 SFT2D3Q587I9 215 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 BEND3Q5T5X7 828 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 ATF7IP2Q5U623 682 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 SCD5Q86SK9 330 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 ISCA2Q86U28 154 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 CCDC50Q8IVM0 306 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 LINC00518Q8N0U6 118 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 DNAAF3Q8N9W5 541 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 OR5D13Q8NGL4 314 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 OR10G8Q8NGN5 311 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 OR8J1Q8NGP2 316 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 OR5M9Q8NGP3 310 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 HPSE2Q8WWQ2 592 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 FCAMRQ8WWV6 532 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 ASB5Q8WWX0 329 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 SLCO2A1Q92959 643 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 UPRTQ96BW1 309 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 CXorf58Q96LI9 332 aa1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP1.95□□□□□ -2.1
PDE4D-218ENST00000509368 GSDMCQ9BYG8 508 aa1.95□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms