RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492417.5

TRA2B-215, Transcript of transformer 2 beta homolog, human

TSL 1 (best)

Gene TRA2B, Length 4,141 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRA2B-215	ENST00000492417	FAM166B	A8MTA8	275 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	BCKDK	O14874	412 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC22A1	O15245	554 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	MAGEB3	O15480	346 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	NKX2-8	O15522	239 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	KLK8	O60259	260 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	UGT2B11	O75310	529 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	APOL3	O95236	402 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	IFNA7	P01567	189 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	GPI	P06744	558 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CD63	P08962	238 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	GP1BB	P13224	206 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CEACAM1	P13688	526 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	PRKACA	P17612	351 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	GPX3	P22352	226 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	GDF1	P27539	372 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	PRDX6	P30041	224 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	TGFBR2	P37173	567 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	HSD17B7	P56937	341 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	INSM1	Q01101	510 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	IL18	Q14116	193 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SNAPC1	Q16533	368 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	NKG7	Q16617	165 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	IFI44L	Q53G44	452 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF385B	Q569K4	471 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CES4A	Q5XG92	561 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	B3GNTL1	Q67FW5	361 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF425	Q6IV72	752 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	PDSS2	Q86YH6	399 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ZDHHC21	Q8IVQ6	265 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC34A3	Q8N130	599 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	D2HGDH	Q8N465	521 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ANKFN1	Q8N957	763 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CDRT4	Q8N9R6	151 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	OR52E4	Q8NGH9	312 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	MS4A4E	Q96PG1	132 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	MCUB	Q9NWR8	336 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	USP22	Q9UPT9	525 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	C11orf98	E9PRG8	122 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	BLOC1S5-TXNDC5	H3BN57	136 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	TNFRSF11B	O00300	401 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	PROM1	O43490	865 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CREG1	O75629	220 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	AGR2	O95994	175 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ICAM2	P13598	275 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ITGA2	P17301	1181 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	TLR1	Q15399	786 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CLEC12A	Q5QGZ9	265 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	DCST1	Q5T197	706 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	VTCN1	Q7Z7D3	282 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC2A12	Q8TD20	617 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	TM9SF4	Q92544	642 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC38A4	Q969I6	547 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SFXN2	Q96NB2	322 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CCDC115	Q96NT0	180 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	AMDHD1	Q96NU7	426 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ZNF768	Q9H5H4	540 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	IL17B	Q9UHF5	180 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CBLC	Q9ULV8	474 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	AKAP6	Q13023	2319 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	IGKV1-8	A0A0C4DH67	115 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	EFCAB9	A8MZ26	197 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417		H0YIG0	161 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	EI24	O14681	340 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	ARPC2	O15144	300 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	OR2J2	O76002	312 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SCEL	O95171	688 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	FABP3	P05413	133 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	SLC35E2	P0CK97	266 aa		4.16	□□□□□ -1.74
TRA2B-215	ENST00000492417	CDK4	P11802	303 aa		4.16	□□□□□ -1.74

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