RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489390.1

SHOC2-205, Transcript of SHOC2, leucine rich repeat scaffold protein, human

TSL 5

Gene SHOC2, Length 815 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SHOC2-205	ENST00000489390	COX5A	P20674	150 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	CD40	P25942	277 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	GP5	P40197	560 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	SPOCK1	Q08629	439 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	IFT88	Q13099	833 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	APOOL	Q6UXV4	268 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	RAPH1	Q70E73	1250 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	FCRLA	Q7L513	359 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	LILRA2	Q8N149	483 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF540	Q8NDQ6	660 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	KCTD4	Q8WVF5	259 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC9A6	Q92581	669 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	NOL11	Q9H8H0	719 aa	Known RBP	12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390		Q9N2J8	555 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	PRSS50	Q9UI38	385 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC12A4	Q9UP95	1085 aa		12.51	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390		A0A1W2PRB8	838 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390		E7ESA3	106 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	UTS2	O95399	124 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	ESRRB	O95718	433 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	CREB1	P16220	341 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	IGHV1-2	P23083	117 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF41	P51814	821 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	CCNG1	P51959	295 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	MANF	P55145	182 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	DEFA6	Q01524	100 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	DEF8	Q6ZN54	512 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC43A2	Q8N370	569 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	CDYL2	Q8N8U2	506 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	POC1B	Q8TC44	478 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM110B	Q8TC76	370 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	EXOSC8	Q96B26	276 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	TRMO	Q9BU70	441 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	BCO1	Q9HAY6	547 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	MYNN	Q9NPC7	610 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	GIMAP4	Q9NUV9	329 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	MED17	Q9NVC6	651 aa		12.5	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390		A0A087WV62	115 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	RGS14	O43566	566 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	CRABP2	P29373	138 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	APOBEC3A	P31941	199 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	MPI	P34949	423 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	SFTPD	P35247	375 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	SPR	P35270	261 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	RFX3	P48380	749 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF83	P51522	516 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	ELOVL6	Q9H5J4	265 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	BRF2	Q9HAW0	419 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	KLHL9	Q9P2J3	617 aa		12.49	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	GJE1	A6NN92	205 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	ALG1L2	C9J202	215 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	SLITRK5	O94991	958 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	PCMT1	P22061	227 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	ELK4	P28324	431 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	SHC1	P29353	583 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	TRAF3	Q13114	568 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNHIT3	Q15649	155 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	CARTPT	Q16568	116 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	SWI5	Q1ZZU3	235 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	SGO1	Q5FBB7	561 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	GRTP1	Q5TC63	336 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	ZBED8	Q8IZ13	594 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	C1orf52	Q8N6N3	182 aa	Known RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	HPS1	Q92902	700 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	PSD2	Q9BQI7	771 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	SHCBP1L	Q9BZQ2	653 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	CXorf36	Q9H7Y0	433 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	C3orf14	Q9HBI5	128 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC35C2	Q9NQQ7	365 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	MCM8	Q9UJA3	840 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	C19orf53	Q9UNZ5	99 aa	Predicted RBP	12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	JRKL	Q9Y4A0	524 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		12.48	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	TP73	O15350	636 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	PSMG1	O95456	288 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	PDYN	P01213	254 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	NGFR	P08138	427 aa		12.47	□□□□□ -0.41
SHOC2-205	ENST00000489390	IL3	P08700	152 aa		12.47	□□□□□ -0.41

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