RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482549.5

PRKRIP1-207, Transcript of PRKR interacting protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRKRIP1, Length 1,625 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1-207ENST00000482549 GSSP48637 474 aa23.4■■□□□ 1.34
PRKRIP1-207ENST00000482549 SLC35A2P78381 396 aa23.4■■□□□ 1.34
PRKRIP1-207ENST00000482549 OCA2Q04671 838 aa23.4■■□□□ 1.34
PRKRIP1-207ENST00000482549 FGFBP1Q14512 234 aa23.4■■□□□ 1.34
PRKRIP1-207ENST00000482549 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa23.4■■□□□ 1.34
PRKRIP1-207ENST00000482549 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa23.4■■□□□ 1.34
PRKRIP1-207ENST00000482549 SPARTQ8N0X7 666 aa23.4■■□□□ 1.34
PRKRIP1-207ENST00000482549 CXorf56Q9H5V9 222 aa23.4■■□□□ 1.34
PRKRIP1-207ENST00000482549 KRCC1Q9NPI7 259 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PRKRIP1-207ENST00000482549 FRG2CA6NGY1 282 aa23.39■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 A8MUA0 341 aa23.39■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 FAM20BO75063 409 aa23.39■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 HTR1AP08908 422 aa23.39■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 GABRB1P18505 474 aa23.39■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 EFNA3P52797 238 aa23.39■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 SLX4IPQ5VYV7 408 aa23.39■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 DBX2Q6ZNG2 339 aa23.39■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa23.39■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 STT3BQ8TCJ2 826 aa23.39■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 UBE2FQ969M7 185 aa23.39■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 CLIP3Q96DZ5 547 aa23.39■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 HOXD1Q9GZZ0 328 aa23.39■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 ZNF226Q9NYT6 803 aa23.39■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 NTNG1Q9Y2I2 539 aa23.39■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 THY1P04216 161 aa23.38■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 FGF5P12034 268 aa23.38■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 POU1F1P28069 291 aa23.38■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 HTR2AP28223 471 aa23.38■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP23.38■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 DCDP81605 110 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 TSPAN31Q12999 210 aa23.38■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 IL11RAQ14626 422 aa23.38■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 OR1Q1Q15612 314 aa23.38■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 CNPY1Q3B7I2 92 aa23.38■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 ZNF613Q6PF04 617 aa23.38■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa23.38■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 TMIGD2Q96BF3 282 aa23.38■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 SLC7A7Q9UM01 511 aa23.38■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa23.38■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 CEPT1Q9Y6K0 416 aa23.38■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 OR6C76A6NM76 312 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 PTGES3LE9PB15 166 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 H3BN98 237 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 TIAF1O95411 115 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 TP53P04637 393 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 ZGLP1P0C6A0 271 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 GKN3PP0CG01 181 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 PRG2P13727 222 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 PLAURQ03405 335 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 NNATQ16517 81 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 C12orf73Q69YU5 71 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 NKAIN4Q8IVV8 208 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 ZNF614Q8N883 585 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 SLC38A9Q8NBW4 561 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 COPS7AQ9UBW8 275 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 AASSQ9UDR5 926 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 SOX14O95416 240 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 IL33O95760 270 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 ACP1P24666 158 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 LCN1P31025 176 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 OMPP47874 163 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 ZNF550Q7Z398 422 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 LAPTM4BQ86VI4 370 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 PRSS58Q8IYP2 241 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 NLGN4XQ8N0W4 816 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 ZNF321PQ8N8H1 164 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 ZNF540Q8NDQ6 660 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 SGCDQ92629 289 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 TMEM27Q9HBJ8 222 aa23.37■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 CCDC160A6NGH7 325 aa23.36■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 FLRT2O43155 660 aa23.36■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 FPR3P25089 353 aa23.36■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 PMS2P3Q13401 168 aa23.36■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 NEDD8Q15843 81 aa23.36■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 TMEM236Q5W0B7 351 aa23.36■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 XAF1Q6GPH4 301 aa23.36■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa23.36■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa23.36■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 CCDC103Q8IW40 242 aa23.36■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 RNF113BQ8IZP6 322 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 AGBL5Q8NDL9 886 aa23.36■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 OR1N1Q8NGS0 311 aa23.36■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 ADIPOR1Q96A54 375 aa23.36■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 NUDT9Q9BW91 350 aa23.36■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 YIPF3Q9GZM5 350 aa23.36■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 SH3D21A4FU49 640 aa23.35■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 CYC1P08574 325 aa23.35■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 PSPHP78330 225 aa23.35■■□□□ 1.33
PRKRIP1-207ENST00000482549 TUBA3CQ13748 450 aa23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms