RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480452.5

DSCR3-208, Transcript of Down syndrome critical region protein 3, human

TSL 2

Gene DSCR3, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DSCR3-208	ENST00000480452	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	LYZL6	O75951	148 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	TSPAN9	O75954	239 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	JTB	O76095	146 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	SFTPB	P07988	381 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	ERCC1	P07992	297 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	KIT	P10721	976 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	COX7A2	P14406	83 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	NPPB	P16860	134 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	RPS3	P23396	243 aa	Known RBP eCLIP	4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	SDHA	P31040	664 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	OR3A2	P47893	321 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	ATP4B	P51164	291 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	GAS1	P54826	345 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	GEM	P55040	296 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	LIM2	P55344	173 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	SUMO3	P55854	103 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	TBPL1	P62380	186 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	ACVR1	Q04771	509 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	STX4	Q12846	297 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	CDK5R2	Q13319	367 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	TIGD6	Q17RP2	521 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	CCDC92	Q53HC0	331 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	ARL13A	Q5H913	290 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	TMEM64	Q6YI46	380 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	DGAT2L6	Q6ZPD8	337 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	ZNF534	Q76KX8	674 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	TRABD2A	Q86V40	505 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	LUZP1	Q86V48	1076 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	C17orf64	Q86WR6	236 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	KRT222	Q8N1A0	295 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	ZNF433	Q8N7K0	673 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	FADS6	Q8N9I5	356 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	GSDMB	Q8TAX9	411 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	RDH11	Q8TC12	318 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	SMARCE1	Q969G3	411 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	SLC35A4	Q96G79	324 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	NODAL	Q96S42	347 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	ADI1	Q9BV57	179 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	CHIA	Q9BZP6	476 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	PALMD	Q9NP74	551 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	CCDC177	Q9NQR7	707 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	CA10	Q9NS85	328 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	RIMKLB	Q9ULI2	386 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	HEY1	Q9Y5J3	304 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	PKD1	P98161	4303 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.75	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452		A0A087X0M5	115 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452		A0A1B0GX30	115 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	OR2M5	A3KFT3	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	OR51F1	A6NGY5	319 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452		F5H0A9	414 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	OR1F1	O43749	312 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	MGRN1	O60291	552 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	LDB3	O75112	727 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	RP2	O75695	350 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	IGHV2-5	P01817	119 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	CDH1	P12830	882 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	TNNI3	P19429	210 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	NR2C2	P49116	596 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	NPY2R	P49146	381 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	NRG3	P56975	720 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	RPS13	P62277	151 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	RCN2	Q14257	317 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	HERPUD1	Q15011	391 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	STK11	Q15831	433 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	ADRM1	Q16186	407 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		4.74	□□□□□ -1.65
DSCR3-208	ENST00000480452	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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