RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 ZNF527Q8NB42 609 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 OR5M1Q8NGP8 315 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 LILRB4Q8NHJ6 448 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 ZPLD1Q8TCW7 415 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 ZFP90Q8TF47 636 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 ITCHQ96J02 903 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 NMUR2Q9GZQ4 415 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 RMND5AQ9H871 391 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 Q9UFV3 132 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 KCNE5Q9UJ90 142 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 MKLN1Q9UL63 735 aa18.96■□□□□ 0.63
ACTB-211ENST00000480301 OR2M5A3KFT3 312 aa18.95■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 OIP5O43482 229 aa18.95■□□□□ 0.62
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ACTB-211ENST00000480301 ZCCHC18P0CG32 403 aa18.95■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 ZNF708P17019 499 aa18.95■□□□□ 0.62
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ACTB-211ENST00000480301 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP18.95■□□□□ 0.622e-17■■■■□ 24.5
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF141Q15928 474 aa18.95■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 BCL2A1Q16548 175 aa18.95■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 TMEM44Q2T9K0 475 aa18.95■□□□□ 0.62
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ACTB-211ENST00000480301 ATAD3BQ5T9A4 648 aa18.95■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 RAET1LQ5VY80 246 aa18.95■□□□□ 0.62
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ACTB-211ENST00000480301 ZNF787Q6DD87 383 aa18.95■□□□□ 0.62
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ACTB-211ENST00000480301 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa18.95■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa18.95■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 GTF2H4Q92759 462 aa18.95■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 TUBA1CQ9BQE3 449 aa18.95■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 NPHS2Q9NP85 383 aa18.95■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 SLC52A3Q9NQ40 469 aa18.95■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 DCTN4Q9UJW0 460 aa18.95■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 VDAC3Q9Y277 283 aa18.95■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 ZNF337Q9Y3M9 751 aa18.95■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 DTNAQ9Y4J8 743 aa18.95■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 CD8B2A6NJW9 211 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 SHISA8B8ZZ34 492 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 C19orf84I3L1E1 186 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 ATP8B1O43520 1251 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 PEPDP12955 493 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 CD1EP15812 388 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 MVDP53602 400 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
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ACTB-211ENST00000480301 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
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ACTB-211ENST00000480301 TNIP2Q8NFZ5 429 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 ROPN1LQ96C74 230 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 TRIB1Q96RU8 372 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 PIGQQ9BRB3 760 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 SIKE1Q9BRV8 207 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 UCK2Q9BZX2 261 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 SAP130Q9H0E3 1048 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 CALHM2Q9HA72 323 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 MED4Q9NPJ6 270 aa18.94■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 A0A087WZY1 265 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 H0Y3Z8 333 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 LINC01387J3KSC0 135 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 HCRTR2O43614 444 aa18.93■□□□□ 0.62
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ACTB-211ENST00000480301 SQLEQ14534 574 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 SLC2A7Q6PXP3 512 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 FRRS1Q6ZNA5 592 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 LIX1LQ8IVB5 337 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 ZNF614Q8N883 585 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 NPAS1Q99742 590 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 TPT1P8Q9HAU6 139 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 POLE3Q9NRF9 147 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 MED17Q9NVC6 651 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 TMEM45AQ9NWC5 275 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 CCDC167Q9P0B6 97 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 ICAM5Q9UMF0 924 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 CARD8Q9Y2G2 431 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 CACNA1CQ13936 2221 aa18.93■□□□□ 0.62
ACTB-211ENST00000480301 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
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