RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464168.5

USP4-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 4

Gene USP4, Length 601 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-208ENST00000464168 MYL2P10916 166 aa20.18■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 NID1P14543 1247 aa20.18■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 AGTR1P30556 359 aa20.18■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 GPC1P35052 558 aa20.18■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 ZNF385BQ569K4 471 aa20.18■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 FIGNL1Q6PIW4 674 aa20.18■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 STK32CQ86UX6 486 aa20.18■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 SLC16A11Q8NCK7 471 aa20.18■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 NUP43Q8NFH3 380 aa20.18■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 FBXO30Q8TB52 745 aa20.18■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa20.18■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 C12orf49Q9H741 205 aa20.18■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 LAMP3Q9UQV4 416 aa20.18■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 CRCPO75575 148 aa20.17■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 TUBBP07437 444 aa20.17■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 PRPH2P23942 346 aa20.17■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 CARD18P57730 90 aa20.17■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 DUSP5Q16690 384 aa20.17■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.17■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 S100PBPQ96BU1 408 aa20.17■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 UBQLN4Q9NRR5 601 aa20.17■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa20.17■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 A0A1W2PPM1 405 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 TBX19O60806 448 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 CRLF1O75462 422 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 PROCP04070 461 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 UROSP10746 265 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 ME2P23368 584 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 FRKP42685 505 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 NAA20P61599 178 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 PDSS1Q5T2R2 415 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 ALKBH2Q6NS38 261 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 ADAM5Q6NVV9 412 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 TRABD2AQ86V40 505 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 LILRA2Q8N149 483 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 MNS1Q8NEH6 495 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 STEAP2Q8NFT2 490 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 SPATA3Q8NHX4 192 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 ROBO4Q8WZ75 1007 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 C16orf58Q96GQ5 468 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 KLHL15Q96M94 604 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 REEP4Q9H6H4 257 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 LRTM1Q9HBL6 345 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 C1orf109Q9NX04 203 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 TBK1Q9UHD2 729 aa20.16■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 ABCA1O95477 2261 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 OVOL3O00110 214 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 AKAP10O43572 662 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 LINGO3P0C6S8 592 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 SHC1P29353 583 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 LCN1P31025 176 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 MANFP55145 182 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 DNAJB13P59910 316 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 CD226Q15762 336 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 CFAP157Q5JU67 520 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 CLEC6AQ6EIG7 209 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 MISPQ8IVT2 679 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 GABRG1Q8N1C3 465 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 CEP112Q8N8E3 955 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 ZFP28Q8NHY6 868 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 ABHD3Q8WU67 409 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 PPCDCQ96CD2 204 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 FCRL1Q96LA6 429 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 MS4A4EQ96PG1 132 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 CCT7Q99832 543 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 HDHD5Q9BXW7 423 aa20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
USP4-208ENST00000464168 CADP27708 2225 aa20.14■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 EFNA2O43921 213 aa20.14■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 NTN1O95631 604 aa20.14■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 HPGDP15428 266 aa20.14■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 SDC1P18827 310 aa20.14■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 PRIM2P49643 509 aa20.14■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 PDE7AQ13946 482 aa20.14■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 TSC22D1Q15714 1073 aa20.14■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 CLEC12BQ2HXU8 276 aa20.14■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 CCNJQ5T5M9 372 aa20.14■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 Q6ZSR9 355 aa20.14■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 SZRD1Q7Z422 152 aa20.14■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa20.14■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 RNF128Q8TEB7 428 aa20.14■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 TSSK3Q96PN8 268 aa20.14■□□□□ 0.81
USP4-208ENST00000464168 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms