RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409985.5

PMS1-205, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

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Gene PMS1, Length 1,882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-205ENST00000409985 RIN1Q13671 783 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 DEFB134Q4QY38 66 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 PRRT3Q5FWE3 981 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ZNF517Q6ZMY9 492 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 SLC43A2Q8N370 569 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 DNAJA4Q8WW22 397 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 COL26A1Q96A83 441 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 DIRAS2Q96HU8 199 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 BMFQ96LC9 184 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 FCRL4Q96PJ5 515 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 INPP5EQ9NRR6 644 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 C14orf105Q9NVL8 296 aa22.1■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 USP34Q70CQ2 3546 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 P2RX6O15547 441 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 CCNKO75909 580 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 HLA-DQB1P01920 261 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 CLEC2LP0C7M8 214 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 COL9A1P20849 921 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 PDZK1Q5T2W1 519 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 A0A1W2PQ09 198 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 HCN1O60741 890 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 CAPZA2P47755 286 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 CLDN2P57739 230 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 DCST2Q5T1A1 773 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 LHFPL3Q86UP9 236 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 OR52L1Q8NGH7 329 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 CD180Q99467 661 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 TM9SF2Q99805 663 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 SLC6A17Q9H1V8 727 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 TBC1D17Q9HA65 648 aa22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 CDHR4A6H8M9 788 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 RCBTB2O95199 551 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 LYPD3O95274 346 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 KLF8O95600 359 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 GPR75O95800 540 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 GCGRP47871 477 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 HOXC5Q00444 222 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ZMAT1Q5H9K5 638 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 MZT2AQ6P582 158 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 LNX2Q8N448 690 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 OR4F15Q8NGB8 312 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 OR6F1Q8NGZ6 308 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 SAMD8Q96LT4 415 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 HS6ST2Q96MM7 605 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 NTNG1Q9Y2I2 539 aa22.08■■□□□ 1.13
PMS1-205ENST00000409985 TMCC2O75069 709 aa22.07■■□□□ 1.12
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PMS1-205ENST00000409985 OR52D1Q9H346 318 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 C2orf74A8MZ97 194 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 BHLHE40O14503 412 aa22.07■■□□□ 1.12
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PMS1-205ENST00000409985 CH25HO95992 272 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 CSF3P09919 207 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 CTBP2P56545 445 aa22.07■■□□□ 1.12
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PMS1-205ENST00000409985 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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PMS1-205ENST00000409985 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 ACOT12Q8WYK0 555 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 SECISBP2Q96T21 854 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
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PMS1-205ENST00000409985 LMAN1LQ9HAT1 526 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 TIGARQ9NQ88 270 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 POT1Q9NUX5 634 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 TOR4AQ9NXH8 423 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 ZNF221Q9UK13 617 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 ADAM30Q9UKF2 790 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 BAIAP2Q9UQB8 552 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa22.07■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 CYR61O00622 381 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 SCAMP1O15126 338 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 SSX4O60224 188 aa22.06■■□□□ 1.12
PMS1-205ENST00000409985 LALBAP00709 142 aa22.06■■□□□ 1.12
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