RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390868.1

RNU1-77P-201, Transcript of RNA, U1 small nuclear 77, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU1-77P, Length 162 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU1-77P-201ENST00000390868 OR51I1Q9H343 314 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU1-77P-201ENST00000390868 C12orf49Q9H741 205 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU1-77P-201ENST00000390868 CALHM2Q9HA72 323 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU1-77P-201ENST00000390868 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU1-77P-201ENST00000390868 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU1-77P-201ENST00000390868 MED17Q9NVC6 651 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU1-77P-201ENST00000390868 ATAD3AQ9NVI7 634 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU1-77P-201ENST00000390868 GPATCH2Q9NW75 528 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU1-77P-201ENST00000390868 KLHL28Q9NXS3 571 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU1-77P-201ENST00000390868 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
RNU1-77P-201ENST00000390868 MKLN1Q9UL63 735 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU1-77P-201ENST00000390868 ABCG2Q9UNQ0 655 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU1-77P-201ENST00000390868 UNC79Q9P2D8 2635 aa4.91□□□□□ -1.62
RNU1-77P-201ENST00000390868 NOTCH2Q04721 2471 aa4.9□□□□□ -1.62
RNU1-77P-201ENST00000390868 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa4.9□□□□□ -1.62
RNU1-77P-201ENST00000390868 A0A0J9YW62 118 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 A0A1W2PNR3 127 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 CLDN24A6NM45 220 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 ALG1L2C9J202 215 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 BIRC5O15392 142 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 EFNA2O43921 213 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 FCMRO60667 390 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 TBX19O60806 448 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 ERLIN1O75477 346 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 SLITRK5O94991 958 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 RCBTB2O95199 551 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 PLGP00747 810 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 CPN1P15169 458 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 TBXA2RP21731 343 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 CHMP24386 653 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 S100A3P33764 101 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 RYKP34925 604 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 OPRM1P35372 400 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 SERPINB5P36952 375 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 RPL3P39023 403 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 MAP3K8P41279 467 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 ART1P52961 327 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 CLDN8P56748 225 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 C17orf67Q0P5P2 114 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 PLPPR5Q32ZL2 321 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 GTDC1Q4AE62 458 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 GPAT3Q53EU6 434 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 COX20Q5RI15 118 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 HBMQ6B0K9 141 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 RNF165Q6ZSG1 346 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 ZNF621Q6ZSS3 439 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 C16orf62Q7Z3J2 963 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 MAVSQ7Z434 540 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 GGNQ86UU5 652 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 RIMKLAQ8IXN7 391 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 ZNF619Q8N2I2 560 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 ZNF610Q8N9Z0 462 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 OR56A1Q8NGH5 318 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 OR9I1Q8NGQ6 314 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 OR10D3Q8NH80 312 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 FBXO27Q8NI29 283 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 POC1BQ8TC44 478 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 FAM110BQ8TC76 370 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 WNT2BQ93097 391 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 COQ8BQ96D53 544 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 ZG16BQ96DA0 208 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 STARD4Q96DR4 205 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 MTERF3Q96E29 417 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 C14orf79Q96F83 325 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 PGM2Q96G03 612 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 OR52B2Q96RD2 323 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 TM9SF2Q99805 663 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 SLC35A5Q9BS91 424 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 SRXN1Q9BYN0 137 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 KLHL4Q9C0H6 718 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 PIGUQ9H490 435 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 MANSC1Q9H8J5 431 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 TMBIM4Q9HC24 238 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 UBQLN4Q9NRR5 601 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 KCNE5Q9UJ90 142 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 PCDHGB4Q9UN71 923 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 FBN2P35556 2912 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 CELSR2Q9HCU4 2923 aa4.9□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 MPDZO75970 2070 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 SH3D21A4FU49 640 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 A6NNC1 897 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 E9PBE3 544 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 SYT5O00445 386 aa4.89□□□□□ -1.63
RNU1-77P-201ENST00000390868 ANKRD28O15084 1053 aa4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms