RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 KIAA0513O60268 411 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 CHRM4P08173 479 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 MAGEA8P43361 318 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 CHRNEQ04844 493 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 TMEM44Q2T9K0 475 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 PDZK1Q5T2W1 519 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 ATAD3BQ5T9A4 648 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 WLSQ5T9L3 541 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 ZNF585AQ6P3V2 769 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 CBLN3Q6UW01 205 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 MISPQ8IVT2 679 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 C10orf111Q8N326 155 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 TSPEARQ8WU66 669 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 ZNF524Q96C55 264 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 NPAS1Q99742 590 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 SLC38A1Q9H2H9 487 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 RUBCNLQ9H714 662 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 POLE3Q9NRF9 147 aa20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 CLIC1O00299 241 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 GMFGO60234 142 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 TNFRSF21O75509 655 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 H6PDO95479 791 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 ACTL6AO96019 429 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 HPGDP15428 266 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 HK1P19367 917 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 MSX1P28360 303 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 STARP49675 285 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 ZNF117Q03924 483 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 RGNQ15493 299 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 ULK2Q8IYT8 1036 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 DPP10Q8N608 796 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 PHOSPHO1Q8TCT1 267 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 DKKL1Q9UK85 242 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 ICAM5Q9UMF0 924 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 LIPT1Q9Y234 373 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 WDR45Q9Y484 360 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 HECTD1Q9ULT8 2610 aa20.19■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 NUDT7P0C024 238 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 TFPTP0C1Z6 253 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 BMP2P12643 396 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 CHMP24386 653 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 ACVR2AP27037 513 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 ADH7P40394 386 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 CRATP43155 626 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 LHX2P50458 406 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 PER3P56645 1201 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 PLAURQ03405 335 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 GANABQ14697 944 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 CDSNQ15517 529 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 NDUFAF6Q330K2 333 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 IFNEQ86WN2 208 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 ZNF619Q8N2I2 560 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 ZNF527Q8NB42 609 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 IKZF5Q9H5V7 419 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 PTGES2Q9H7Z7 377 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 CARD8Q9Y2G2 431 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 NDUFAF1Q9Y375 327 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa20.18■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 SERINC4A6NH21 518 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 SHISA8B8ZZ34 492 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 FBP2O00757 339 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 WDR1O75083 606 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 CLDN1O95832 211 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 CPN1P15169 458 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 LSP1P33241 339 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 KLF10Q13118 480 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 GPAT3Q53EU6 434 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 SEM1Q6ZVN7 128 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 HMGN2P46Q86SG4 172 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 OR5M1Q8NGP8 315 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 B4GALNT2Q8NHY0 566 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 TTYH2Q9BSA4 534 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 ZNF337Q9Y3M9 751 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 L3MBTL1Q9Y468 752 aa20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 OR2M5A3KFT3 312 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 FIGNL2A6NMB9 653 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 AHRRA9YTQ3 701 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 DRD4P21917 467 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 CLDN15P56746 228 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 CLDN18P56856 261 aa20.16■□□□□ 0.82
SYF2-201ENST00000236273 RUNDC3AQ59EK9 446 aa20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.1 ms