RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 COLEC12Q5KU26 742 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 PRR22Q8IZ63 422 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 PIK3C3Q8NEB9 887 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 OR11G2Q8NGC1 345 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52J3Q8NH60 311 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ELP5Q8TE02 316 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 PRRC1Q96M27 445 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM117AQ9C073 453 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 EVA1AQ9H8M9 152 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 SMURF2Q9HAU4 748 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 UBQLN4Q9NRR5 601 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 KNTC1P50748 2209 aa22.93■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 C21orf140B9A014 251 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 STMND1H3BQB6 276 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ZFAND5O76080 213 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCD3P28288 659 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF136P52737 540 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 PLCXD2Q0VAA5 305 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 DNASE1L3Q13609 305 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 SSPNQ14714 243 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ZSWIM7Q19AV6 140 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 EXOC3L2Q2M3D2 409 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 GALNT15Q8N3T1 639 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF614Q8N883 585 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 OR5L2Q8NGL0 311 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 NR4A3Q92570 626 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ADOQ96SZ5 270 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR87Q9BY21 358 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 PTPRBP23467 1997 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 REM1O75628 298 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 H1F0P07305 194 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 PNLIPRP2P54317 469 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 EXT1Q16394 746 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 BTBD16Q32M84 506 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHL26Q53HC5 615 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 NHSL2Q5HYW2 709 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD34AQ69YU3 496 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 CMIPQ8IY22 773 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 OMA1Q96E52 524 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 PRR14Q9BWN1 585 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 OSBPL11Q9BXB4 747 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 FLRT3Q9NZU0 649 aa22.92■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 DMXL1Q9Y485 3027 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 AP3D1O14617 1153 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCB7O75027 752 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 UTS2O95399 124 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 TBXA2RP21731 343 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 F8A1P23610 371 aa22.91■■□□□ 1.26
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CAPNS1-215ENST00000628018 KRT20P35900 424 aa22.91■■□□□ 1.26
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CAPNS1-215ENST00000628018 MICAQ29983 383 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 PLAG1Q6DJT9 500 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 NDUFAF7Q7L592 441 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 M1APQ8TC57 530 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 GIPC3Q8TF64 312 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 CNOT9Q92600 299 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
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CAPNS1-215ENST00000628018 ALPK1Q96QP1 1244 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 MCHR1Q99705 422 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 DLL3Q9NYJ7 618 aa22.91■■□□□ 1.26
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CAPNS1-215ENST00000628018 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa22.91■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 SERINC4A6NH21 518 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 CDRT15L2A8MXV6 281 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 CYP4B1P13584 511 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 CD82P27701 267 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ADH7P40394 386 aa22.9■■□□□ 1.26
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CAPNS1-215ENST00000628018 NRG3P56975 720 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 ENTPD8Q5MY95 495 aa22.9■■□□□ 1.26
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CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF527Q8NB42 609 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC35B4Q969S0 331 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 RDH12Q96NR8 316 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 PSD2Q9BQI7 771 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 FUZQ9BT04 418 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 FNDC11Q9BVV2 318 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 MMP25Q9NPA2 562 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 LRCH1Q9Y2L9 728 aa22.9■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa22.89■■□□□ 1.26
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1W2PRQ8 180 aa22.89■■□□□ 1.26
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