RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589347.1

CLPTM1-211, Transcript of CLPTM1, transmembrane protein, humanhuman

TSL 3

Gene CLPTM1, Length 638 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPTM1-211ENST00000589347 GRAMD1BQ3KR37 738 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 ATG16L1Q676U5 607 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 OR2A2Q6IF42 318 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 CDC73Q6P1J9 531 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 ARSKQ6UWY0 536 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 SEM1Q6ZVN7 128 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 CAMKMTQ7Z624 323 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 KIF18BQ86Y91 864 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 ANKRD42Q8N9B4 389 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 VPS37AQ8NEZ2 397 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 ADAMTS15Q8TE58 950 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 WNT2BQ93097 391 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 GIMAP5Q96F15 307 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 C3orf30Q96M34 536 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 TUBA1CQ9BQE3 449 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 BTBD2Q9BX70 525 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 ACTRT3Q9BYD9 372 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 DPY30Q9C005 99 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 GIN1Q9NXP7 522 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 PCDHGB4Q9UN71 923 aa9.6□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 A0A1W2PQD3 144 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 FAM221AA4D161 298 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 ALG1L2C9J202 215 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 H3BML4 177 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 H3BNH8 94 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 SEC14L5O43304 696 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 HCRTR2O43614 444 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 ITM2AO43736 263 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 KCNK2O95069 426 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 C6orf47O95873 294 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 AK1P00568 194 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 LAMP1P11279 417 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 G6PDP11413 515 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 ARRB2P32121 409 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 MAP3K8P41279 467 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 KIR2DL3P43628 341 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 CCT3P49368 545 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 ZNF136P52737 540 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 WNT3P56703 355 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 CLDN8P56748 225 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 CLDN18P56856 261 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 FGFBP1Q14512 234 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 DUSP5Q16690 384 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 PGS1Q32NB8 556 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 FLYWCH1Q4VC44 716 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 FIGNL1Q6PIW4 674 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 MARCH3Q86UD3 253 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 LIX1LQ8IVB5 337 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 UBQLNLQ8IYU4 475 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 C9orf106Q8NAJ2 232 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 SLC16A11Q8NCK7 471 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 NAXEQ8NCW5 288 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 PSMA8Q8TAA3 256 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 DUSP19Q8WTR2 217 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 SMPDL3BQ92485 455 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 CDS1Q92903 461 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 ZBTB8AQ96BR9 441 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 COQ8BQ96D53 544 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 SLC35G5Q96KT7 338 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 PPP1R36Q96LQ0 422 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 UCN2Q96RP3 112 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 YIPF4Q9BSR8 244 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 HOXD1Q9GZZ0 328 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 PIGMQ9H3S5 423 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 PIGUQ9H490 435 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 UBQLN4Q9NRR5 601 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 FLRT3Q9NZU0 649 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 MED11Q9P086 117 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 CLCF1Q9UBD9 225 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 HAO1Q9UJM8 370 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 L3MBTL1Q9Y468 752 aa9.59□□□□□ -0.87
CLPTM1-211ENST00000589347 JMJD1CQ15652 2540 aa9.58□□□□□ -0.88
CLPTM1-211ENST00000589347 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa9.58□□□□□ -0.88
CLPTM1-211ENST00000589347 TMEM120BA0PK00 339 aa9.58□□□□□ -0.88
CLPTM1-211ENST00000589347 OR2M5A3KFT3 312 aa9.58□□□□□ -0.88
CLPTM1-211ENST00000589347 SLC22A20A6NK97 555 aa9.58□□□□□ -0.88
CLPTM1-211ENST00000589347 DUXAA6NLW8 204 aa9.58□□□□□ -0.88
CLPTM1-211ENST00000589347 TRPC5OSA6NMA1 111 aa9.58□□□□□ -0.88
CLPTM1-211ENST00000589347 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CLPTM1-211ENST00000589347 RCBTB2O95199 551 aa9.58□□□□□ -0.88
CLPTM1-211ENST00000589347 AGR2O95994 175 aa9.58□□□□□ -0.88
CLPTM1-211ENST00000589347 IGKV1D-16P01601 117 aa9.58□□□□□ -0.88
CLPTM1-211ENST00000589347 CRHP06850 196 aa9.58□□□□□ -0.88
CLPTM1-211ENST00000589347 LBPP18428 481 aa9.58□□□□□ -0.88
CLPTM1-211ENST00000589347 TBXA2RP21731 343 aa9.58□□□□□ -0.88
CLPTM1-211ENST00000589347 ME2P23368 584 aa9.58□□□□□ -0.88
CLPTM1-211ENST00000589347 SORDQ00796 357 aa9.58□□□□□ -0.88
CLPTM1-211ENST00000589347 DCST2Q5T1A1 773 aa9.58□□□□□ -0.88
CLPTM1-211ENST00000589347 ANXA8L1Q5VT79 327 aa9.58□□□□□ -0.88
CLPTM1-211ENST00000589347 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
CLPTM1-211ENST00000589347 RIMKLAQ8IXN7 391 aa9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms