RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 RRM2P31350 389 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 TMED10P49755 219 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 SMIM11AP58511 58 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 EFR3AQ14156 821 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 EPHX4Q8IUS5 362 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4D11Q8NGI4 311 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC22A8Q8TCC7 542 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 COQ10BQ9H8M1 238 aa28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CAPNS1-206ENST00000588815 HPGDP15428 266 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 IFNA8P32881 189 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 HMGA2P52926 109 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHL26Q53HC5 615 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 DEF8Q6ZN54 512 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 LACC1Q8IV20 430 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4C3Q8NH37 302 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 PRRC1Q96M27 445 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ADOQ96SZ5 270 aa28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 HEATR5AQ86XA9 2040 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 SCDO00767 359 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 AP3D1O14617 1153 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 PPM1BO75688 479 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 RASAL1O95294 804 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 UTS2O95399 124 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 SPIBQ01892 262 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 MRGPREQ86SM8 312 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 RANBP3LQ86VV4 465 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF614Q8N883 585 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 DHRS1Q96LJ7 313 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF160Q9HCG1 818 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 RLIMQ9NVW2 624 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 P4HTMQ9NXG6 502 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 DOCK10Q96BY6 2186 aa28.56■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PQD3 144 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 SERINC4A6NH21 518 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 FMO6PO60774 539 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 CYP4B1P13584 511 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 IZUMO2Q6UXV1 221 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 PRR22Q8IZ63 422 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ARMC10Q8N2F6 343 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 NXPE2Q96DL1 559 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 TESMINQ9Y4I5 508 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa28.55■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 CLDN24A6NM45 220 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 NADKO95544 446 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 COLEC12Q5KU26 742 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF440Q8IYI8 595 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 CBR4Q8N4T8 237 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 WFDC6Q9BQY6 131 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXL4Q9UKA2 621 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 A4GNTQ9UNA3 340 aa28.54■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 H3BNH8 94 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 J3KTA2 159 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFRSF11BO00300 401 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 WWP2O00308 870 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 GADD45GO95257 159 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 HSPA13P48723 471 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 CHAF1BQ13112 559 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 IL10RAQ13651 578 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 NPTX1Q15818 432 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF550Q7Z398 422 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 STK32CQ86UX6 486 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 PIK3C3Q8NEB9 887 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ACER3Q9NUN7 267 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 VNN3Q9NY84 501 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 PRDM4Q9UKN5 801 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 AK5Q9Y6K8 562 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 U3KQV3 271 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 DCDC2BA2VCK2 349 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 SOCS2O14508 198 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 FFAR1O14842 300 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 HPRP00739 348 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 YAP1P46937 504 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 CDH12P55289 794 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 NUP54Q7Z3B4 507 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 OFCC1Q8IZS5 231 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC9Q92623 222 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC29A1Q99808 456 aa28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 PDLIM1O00151 329 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 ICOSLGO75144 302 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 SEMA7AO75326 666 aa28.52■■■□□ 2.16
CAPNS1-206ENST00000588815 CSTAP01040 98 aa28.52■■■□□ 2.16
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