RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540870.5

SP110-215, Transcript of SP110 nuclear body protein, humanhuman

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Gene SP110, Length 2,032 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110-215ENST00000540870 RPS6KA6Q9UK32 745 aa7.96□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa7.96□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa7.96□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 RAB19A4D1S5 217 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 BLACEA4D250 179 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 PCDH17O14917 1159 aa7.95□□□□□ -1.14
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SP110-215ENST00000540870 CTNSO60931 367 aa7.95□□□□□ -1.14
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SP110-215ENST00000540870 KLK3P07288 261 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 RAB3AP20336 220 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 AGXTP21549 392 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 FRKP42685 505 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 GCGRP47871 477 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 GSK3BP49841 420 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 TSPAN5P62079 268 aa7.95□□□□□ -1.14
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SP110-215ENST00000540870 CYP51A1Q16850 503 aa7.95□□□□□ -1.14
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SP110-215ENST00000540870 C3orf38Q5JPI3 329 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 MLIPQ5VWP3 458 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
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SP110-215ENST00000540870 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 P3H2Q8IVL5 708 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 SUN3Q8TAQ9 357 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 ZFP90Q8TF47 636 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 YIPF5Q969M3 257 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
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SP110-215ENST00000540870 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 TMEM246Q9BRR3 403 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 BCL2L14Q9BZR8 327 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 PCDHAC1Q9H158 963 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 PPA2Q9H2U2 334 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 AKIP1Q9NQ31 210 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 IFT46Q9NQC8 304 aa7.95□□□□□ -1.14
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SP110-215ENST00000540870 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 CTSFQ9UBX1 484 aa7.95□□□□□ -1.14
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SP110-215ENST00000540870 CORO2BQ9UQ03 480 aa7.95□□□□□ -1.14
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SP110-215ENST00000540870 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa7.95□□□□□ -1.14
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SP110-215ENST00000540870 TSPAN4O14817 238 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 GSTA4O15217 222 aa7.95□□□□□ -1.14
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SP110-215ENST00000540870 ZNF28P17035 718 aa7.95□□□□□ -1.14
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SP110-215ENST00000540870 TNNI3P19429 210 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 PPIBP23284 216 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
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SP110-215ENST00000540870 HLCSP50747 726 aa7.95□□□□□ -1.14
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SP110-215ENST00000540870 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
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SP110-215ENST00000540870 MFSD13AQ14CX5 517 aa7.95□□□□□ -1.14
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SP110-215ENST00000540870 DGAT2Q96PD7 388 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 OR1F2PQ96R84 312 aa7.95□□□□□ -1.14
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SP110-215ENST00000540870 ANKRA2Q9H9E1 313 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 C3orf14Q9HBI5 128 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
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SP110-215ENST00000540870 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 CD300AQ9UGN4 299 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 ZNF221Q9UK13 617 aa7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 NUP210LQ5VU65 1888 aa7.94□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 CCDC187A0A096LP49 1063 aa7.94□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.94□□□□□ -1.14
SP110-215ENST00000540870 FAM149AA5PLN7 773 aa7.94□□□□□ -1.14
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