RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516614.1

RNU6-229P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 229, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-229P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-229P-201ENST00000516614 GCKP35557 465 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 DEKP35659 375 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 KRT20P35900 424 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 CD79BP40259 229 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 PRPHP41219 470 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ELK3P41970 407 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 SLC1A1P43005 524 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 MAGEB1P43366 347 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 RPL21P46778 160 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 STT3AP46977 705 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 FASLGP48023 281 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 MARCKSL1P49006 195 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 CENPAP49450 140 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 COMPP49747 757 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
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RNU6-229P-201ENST00000516614 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 CLCN2P51788 898 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 GPR143P51810 404 aa0.46□□□□□ -2.34
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RNU6-229P-201ENST00000516614 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
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RNU6-229P-201ENST00000516614 AQP5P55064 265 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 MTTPP55157 894 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 RAG2P55895 527 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 SLC37A1P57057 533 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 EVCP57679 992 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 OR2B6P58173 313 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 TAS2R40P59535 323 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ANAPC15P60006 121 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 KRTAP10-12P60413 245 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ERVS71-1P61550 626 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 AP1S1P61966 158 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 RPS13P62277 151 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 UBA52P62987 128 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
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RNU6-229P-201ENST00000516614 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 CCL8P80075 99 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 MPP1Q00013 466 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 PLIN5Q00G26 463 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 RHAGQ02094 409 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 HSF2Q03933 536 aa0.46□□□□□ -2.34
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RNU6-229P-201ENST00000516614 ACVR1Q04771 509 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 CACNG1Q06432 222 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 TNFRSF9Q07011 255 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP0.46□□□□□ -2.34
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RNU6-229P-201ENST00000516614 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 PLCXD2Q0VAA5 305 aa0.46□□□□□ -2.34
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RNU6-229P-201ENST00000516614 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 LCP2Q13094 533 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 IFT88Q13099 833 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 SLAMF1Q13291 335 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 MTA1Q13330 715 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 CTBP1Q13363 440 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 PEX6Q13608 980 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 FHL3Q13643 280 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ALCAMQ13740 583 aa0.46□□□□□ -2.34
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RNU6-229P-201ENST00000516614 KCNJ11Q14654 390 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 RAB39AQ14964 217 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 ODF1Q14990 250 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 NR1D2Q14995 579 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 SLMAPQ14BN4 828 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 PON3Q15166 354 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 PPA1Q15181 289 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 TMED2Q15363 201 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 LTB4RQ15722 352 aa0.46□□□□□ -2.34
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RNU6-229P-201ENST00000516614 TBCCQ15814 346 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 INAQ16352 499 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 EXT1Q16394 746 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 TAF9Q16594 264 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 NDUFA9Q16795 377 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 PPP1R3AQ16821 1122 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 EXOC3L4Q17RC7 722 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 KLHL38Q2WGJ6 581 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 DEFB136Q30KP8 78 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 DEFB112Q30KQ8 113 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 PGGHGQ32M88 737 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 DPCR1Q3MIW9 517 aa0.46□□□□□ -2.34
RNU6-229P-201ENST00000516614 C3orf36Q3SXR2 165 aa0.46□□□□□ -2.34
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