RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 RNF122Q9H9V4 155 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa25.04■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 MSTNO14793 375 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 DIO3P55073 304 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 IFFO1Q0D2I5 559 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 BTLAQ7Z6A9 289 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 PINK1Q9BXM7 581 aa25.03■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 SEC14L5O43304 696 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 SLU7O95391 586 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 CGAP01215 116 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 HRGP04196 525 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 PSMA4P25789 261 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 PCYT1AP49585 367 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 OCRLQ01968 901 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 OR2A2Q6IF42 318 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 PAMR1Q6UXH9 720 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 RIMKLAQ8IXN7 391 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 FNDC9Q8TBE3 224 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 YIPF4Q9BSR8 244 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 C1orf50Q9BV19 199 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF175Q9Y473 711 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 AP4B1Q9Y6B7 739 aa25.02■■□□□ 1.6
HOXB3-211ENST00000490677 TMEM114B3SHH9 223 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 GMFGO60234 142 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 GOSR1O95249 250 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 HPCAL1P37235 193 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 CPA2P48052 419 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 CCNJQ5T5M9 372 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 SZRD1Q7Z422 152 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 P4HA3Q7Z4N8 544 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 MREGQ8N565 214 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 GATSQ8NAP1 163 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 COQ8BQ96D53 544 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 ADGRG7Q96K78 797 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 TMUB1Q9BVT8 246 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 VDAC3Q9Y277 283 aa25.01■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 PRR14LQ5THK1 2151 aa25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 SH3D21A4FU49 640 aa25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 NDUFB5O43674 189 aa25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 ALOX5P09917 674 aa25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF17P17021 662 aa25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 MAPK1P28482 360 aa25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 CCKARP32238 428 aa25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 RIPPLY3P57055 190 aa25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 FAM27E3Q08E93 113 aa25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 PON3Q15166 354 aa25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 CHMP1BQ7LBR1 199 aa25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 MBD6Q96DN6 1003 aa25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 STACQ99469 402 aa25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 BTBD2Q9BX70 525 aa25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 CXorf36Q9H7Y0 433 aa25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 DUSP22Q9NRW4 184 aa25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 GPATCH2Q9NW75 528 aa25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 GIN1Q9NXP7 522 aa25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 TESMINQ9Y4I5 508 aa25■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PRB8 838 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 C7orf72A4D263 438 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 SIAH2O43255 324 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 AQP8O94778 261 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 LCN1P31025 176 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 CD226Q15762 336 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 PLPPR5Q32ZL2 321 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 FREM1Q5H8C1 2179 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 IL23RQ5VWK5 629 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 POC1BQ8TC44 478 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 CDS1Q92903 461 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 PGM2Q96G03 612 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 PIGUQ9H490 435 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 UBQLN4Q9NRR5 601 aa24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 V9GYY5 206 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 A0A1W2PQD3 144 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 ITM2AO43736 263 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 ATE1O95260 518 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 CPOXP36551 454 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 RPL3P39023 403 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 PRIM2P49643 509 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 C21orf58P58505 322 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 CDC73Q6P1J9 531 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 COX18Q8N8Q8 333 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 ACTRT2Q8TDY3 377 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 OR5P2Q8WZ92 322 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 SMPDL3BQ92485 455 aa24.98■■□□□ 1.59
HOXB3-211ENST00000490677 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.5 ms