RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449504.5

HDLBP-222, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-222ENST00000449504 KLHL13Q9P2N7 655 aa6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 USP22Q9UPT9 525 aa6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa6.31□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 GOLGA8OA6NCC3 632 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 FAM187AA6NFU0 413 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 ESPNB1AK53 854 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 B4DSR2 109 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 GOLGA8NF8WBI6 632 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 GOLGA8RI6L899 631 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 FADS1O60427 444 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 KERAO60938 352 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 TTC4O95801 387 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 FGGP02679 453 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 ATP1B1P05026 303 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 HKR1P10072 659 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 ME2P23368 584 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 EDNRAP25101 427 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 MAGEA3P43357 314 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 PIK3CGP48736 1102 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 ALDH9A1P49189 494 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 ARFIP1P53367 373 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 SLC12A2P55011 1212 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 RAC1P63000 192 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 OR4D1Q15615 310 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 MST1LQ2TV78 715 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 SLC48A1Q6P1K1 146 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 RAD9BQ6WBX8 426 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 FCRLAQ7L513 359 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 GALNT7Q86SF2 657 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 P2RY8Q86VZ1 359 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 TDRPQ86YL5 185 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF100Q8IYN0 542 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 CCDC116Q8IYX3 515 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 RNF128Q8TEB7 428 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 KLHL29Q96CT2 875 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 CFAP36Q96G28 342 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 KLHL15Q96M94 604 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 RNF145Q96MT1 663 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 NARFLQ9H6Q4 476 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 FKRPQ9H9S5 495 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 MED29Q9NX70 200 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 OPTCQ9UBM4 332 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 MCM8Q9UJA3 840 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 CES1P1Q9UKY3 287 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa6.3□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 C1orf226A1L170 272 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 K7EPI3 171 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 PGM3O95394 542 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 ANGPTL1O95841 491 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 BCL10O95999 233 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 IGHV3-9P01782 118 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 TACSTD2P09758 323 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 DAOP14920 347 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 IFNGR1P15260 489 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 SHC1P29353 583 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 OR3A2P47893 321 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 MAPK12P53778 367 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 UBA52P62987 128 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 PRR20EP86478 221 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 PRR20CP86479 221 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 PRR20DP86480 221 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 PRR20BP86481 221 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 PRR20AP86496 221 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 C17orf67Q0P5P2 114 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 CUL3Q13618 768 aa6.29□□□□□ -1.4
HDLBP-222ENST00000449504 E2F2Q14209 437 aa6.29□□□□□ -1.4
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