RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 NPIPB8E9PQR5 432 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 REM1O75628 298 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 DCTN3O75935 186 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 CHMP24386 653 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 IL12BP29460 328 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 SOX18P35713 384 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 RFX3P48380 749 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 EMDP50402 254 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 PRKAG1P54619 331 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 MANFP55145 182 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 CORO7P57737 925 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 PTGR1Q14914 329 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 ZNF385BQ569K4 471 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 C6orf136Q5SQH8 315 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 POMZP3Q6PJE2 187 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 C17orf47Q8NEP4 570 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 TMBIM1Q969X1 311 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 ERP27Q96DN0 273 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 TMEM41AQ96HV5 264 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 ANGPTL4Q9BY76 406 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 UBQLN3Q9H347 655 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 PROK2Q9HC23 129 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 TAS2R9Q9NYW1 312 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 KLRF1Q9NZS2 232 aa10.6□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 ATRQ13535 2644 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 ARID1AO14497 2285 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 UBDO15205 165 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 ACOX3O15254 700 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 RRP9O43818 475 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 PLOD3O60568 738 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 CCDC22O60826 627 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 PPM1BO75688 479 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 PRPS2P11908 318 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 DDX5P17844 614 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 PPICP45877 212 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 PCYT1AP49585 367 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 STX1BP61266 288 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 POU4F3Q15319 338 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 METTL21CQ5VZV1 264 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 DESI1Q6ICB0 168 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 OGFOD2Q6N063 350 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 SPATA19Q7Z5L4 167 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 OR7A2PQ8NGA2 310 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 OR1J4Q8NGS1 313 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 FBXO30Q8TB52 745 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 SPPL2AQ8TCT8 520 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 ELP4Q96EB1 424 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 WDYHV1Q96HA8 205 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 UGT2B28Q9BY64 529 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 NMUR2Q9GZQ4 415 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 GALNT8Q9NY28 637 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 TAS2R7Q9NYW3 318 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 SLC6A5Q9Y345 797 aa10.59□□□□□ -0.71
PRAME-210ENST00000442481 NCKAP5O14513 1909 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 FREM3P0C091 2139 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 DOCK7Q96N67 2140 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 STAB1Q9NY15 2570 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 C2orf72A6NCS6 295 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 H0Y3Z8 333 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 UPK1AO00322 258 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 GNB5O14775 395 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 UGT2B11O75310 529 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 RCBTB2O95199 551 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 LY6G6DO95868 133 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 G6PDP11413 515 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CPN1P15169 458 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 NAGAP17050 411 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 DRD5P21918 477 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 RPL3P39023 403 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 NME5P56597 212 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 WNT3P56703 355 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 EMX2Q04743 252 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SNTA1Q13424 505 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PDE7AQ13946 482 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SQLEQ14534 574 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 PGS1Q32NB8 556 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SPDYE7PQ495Y7 208 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CPTPQ5TA50 214 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 TIGD3Q6B0B8 471 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 SLC30A6Q6NXT4 461 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 AAGABQ6PD74 315 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 NPSR1Q6W5P4 371 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 C20orf204Q6ZNR8 217 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 LUZP2Q86TE4 346 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 OR4N2Q8NGD1 307 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 WNT2BQ93097 391 aa10.58□□□□□ -0.72
PRAME-210ENST00000442481 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.9 ms